Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUD0

Gpr4, G-protein coupled receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr4Q8BUD0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gpr4Q8BUD0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gpr4Q8BUD0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpr4Q8BUD0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gpr4Q8BUD0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gpr4Q8BUD0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpr4Q8BUD0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gpr4Q8BUD0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpr4Q8BUD0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gpr4Q8BUD0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpr4Q8BUD0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gpr4Q8BUD0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gpr4Q8BUD0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gpr4Q8BUD0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gpr4Q8BUD0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpr4Q8BUD0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gpr4Q8BUD0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpr4Q8BUD0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpr4Q8BUD0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gpr4Q8BUD0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpr4Q8BUD0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gpr4Q8BUD0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gpr4Q8BUD0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpr4Q8BUD0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gpr4Q8BUD0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpr4Q8BUD0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gpr4Q8BUD0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpr4Q8BUD0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gpr4Q8BUD0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gpr4Q8BUD0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gpr4Q8BUD0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms