Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Tnrc6bQ8BKI2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Tnrc6bQ8BKI2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Tnrc6bQ8BKI2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Tnrc6bQ8BKI2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Tnrc6bQ8BKI2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Tnrc6bQ8BKI2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Tnrc6bQ8BKI2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Tnrc6bQ8BKI2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Tnrc6bQ8BKI2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Tnrc6bQ8BKI2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Tnrc6bQ8BKI2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Tnrc6bQ8BKI2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Tnrc6bQ8BKI2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Tnrc6bQ8BKI2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Tnrc6bQ8BKI2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Tnrc6bQ8BKI2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Tnrc6bQ8BKI2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Tnrc6bQ8BKI2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Tnrc6bQ8BKI2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Tnrc6bQ8BKI2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Tnrc6bQ8BKI2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Tnrc6bQ8BKI2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Tnrc6bQ8BKI2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Tnrc6bQ8BKI2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Tnrc6bQ8BKI2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Tnrc6bQ8BKI2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Tnrc6bQ8BKI2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Tnrc6bQ8BKI2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Tnrc6bQ8BKI2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Tnrc6bQ8BKI2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
Tnrc6bQ8BKI2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Tnrc6bQ8BKI2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Tnrc6bQ8BKI2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Tnrc6bQ8BKI2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Tnrc6bQ8BKI2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Tnrc6bQ8BKI2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Tnrc6bQ8BKI2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Tnrc6bQ8BKI2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Tnrc6bQ8BKI2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Tnrc6bQ8BKI2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Tnrc6bQ8BKI2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Tnrc6bQ8BKI2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Tnrc6bQ8BKI2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Tnrc6bQ8BKI2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Tnrc6bQ8BKI2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Tnrc6bQ8BKI2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Tnrc6bQ8BKI2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.79■■■■□ 3.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Tnrc6bQ8BKI2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Tnrc6bQ8BKI2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Tnrc6bQ8BKI2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Tnrc6bQ8BKI2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Tnrc6bQ8BKI2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Tnrc6bQ8BKI2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.14
Tnrc6bQ8BKI2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Tnrc6bQ8BKI2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Tnrc6bQ8BKI2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Tnrc6bQ8BKI2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
Tnrc6bQ8BKI2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Tnrc6bQ8BKI2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Tnrc6bQ8BKI2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Tnrc6bQ8BKI2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Tnrc6bQ8BKI2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Tnrc6bQ8BKI2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Tnrc6bQ8BKI2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Tnrc6bQ8BKI2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Tnrc6bQ8BKI2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.13
Tnrc6bQ8BKI2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Tnrc6bQ8BKI2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
Tnrc6bQ8BKI2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Tnrc6bQ8BKI2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Tnrc6bQ8BKI2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Tnrc6bQ8BKI2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Tnrc6bQ8BKI2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Tnrc6bQ8BKI2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms