Protein–RNA interactions for Protein: Q811W2

Cyp26b1, Cytochrome P450 26B1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26b1Q811W2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cyp26b1Q811W2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Cyp26b1Q811W2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cyp26b1Q811W2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cyp26b1Q811W2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cyp26b1Q811W2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cyp26b1Q811W2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cyp26b1Q811W2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cyp26b1Q811W2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cyp26b1Q811W2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cyp26b1Q811W2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cyp26b1Q811W2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Cyp26b1Q811W2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Cyp26b1Q811W2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Cyp26b1Q811W2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cyp26b1Q811W2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Cyp26b1Q811W2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cyp26b1Q811W2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cyp26b1Q811W2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Cyp26b1Q811W2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Cyp26b1Q811W2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cyp26b1Q811W2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Cyp26b1Q811W2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Cyp26b1Q811W2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Cyp26b1Q811W2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Cyp26b1Q811W2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Cyp26b1Q811W2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Cyp26b1Q811W2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Cyp26b1Q811W2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Cyp26b1Q811W2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Cyp26b1Q811W2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cyp26b1Q811W2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Cyp26b1Q811W2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cyp26b1Q811W2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Cyp26b1Q811W2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cyp26b1Q811W2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Cyp26b1Q811W2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Cyp26b1Q811W2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cyp26b1Q811W2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cyp26b1Q811W2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cyp26b1Q811W2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Cyp26b1Q811W2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Cyp26b1Q811W2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cyp26b1Q811W2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cyp26b1Q811W2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cyp26b1Q811W2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cyp26b1Q811W2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cyp26b1Q811W2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cyp26b1Q811W2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cyp26b1Q811W2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Cyp26b1Q811W2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cyp26b1Q811W2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cyp26b1Q811W2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
Cyp26b1Q811W2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cyp26b1Q811W2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cyp26b1Q811W2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cyp26b1Q811W2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cyp26b1Q811W2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cyp26b1Q811W2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cyp26b1Q811W2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cyp26b1Q811W2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cyp26b1Q811W2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cyp26b1Q811W2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cyp26b1Q811W2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cyp26b1Q811W2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cyp26b1Q811W2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cyp26b1Q811W2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cyp26b1Q811W2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cyp26b1Q811W2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cyp26b1Q811W2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cyp26b1Q811W2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cyp26b1Q811W2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cyp26b1Q811W2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cyp26b1Q811W2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cyp26b1Q811W2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cyp26b1Q811W2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cyp26b1Q811W2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cyp26b1Q811W2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cyp26b1Q811W2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cyp26b1Q811W2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Cyp26b1Q811W2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cyp26b1Q811W2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cyp26b1Q811W2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cyp26b1Q811W2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Cyp26b1Q811W2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cyp26b1Q811W2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cyp26b1Q811W2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Cyp26b1Q811W2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Cyp26b1Q811W2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cyp26b1Q811W2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cyp26b1Q811W2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cyp26b1Q811W2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cyp26b1Q811W2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Cyp26b1Q811W2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cyp26b1Q811W2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cyp26b1Q811W2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cyp26b1Q811W2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cyp26b1Q811W2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp26b1Q811W2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cyp26b1Q811W2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms