Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ChfrQ810L3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChfrQ810L3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChfrQ810L3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ChfrQ810L3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ChfrQ810L3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ChfrQ810L3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ChfrQ810L3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChfrQ810L3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChfrQ810L3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ChfrQ810L3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ChfrQ810L3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ChfrQ810L3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChfrQ810L3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChfrQ810L3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ChfrQ810L3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChfrQ810L3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ChfrQ810L3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ChfrQ810L3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
ChfrQ810L3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChfrQ810L3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ChfrQ810L3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChfrQ810L3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ChfrQ810L3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ChfrQ810L3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ChfrQ810L3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ChfrQ810L3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChfrQ810L3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ChfrQ810L3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChfrQ810L3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ChfrQ810L3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ChfrQ810L3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChfrQ810L3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ChfrQ810L3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ChfrQ810L3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChfrQ810L3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ChfrQ810L3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChfrQ810L3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChfrQ810L3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChfrQ810L3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChfrQ810L3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ChfrQ810L3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChfrQ810L3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ChfrQ810L3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ChfrQ810L3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ChfrQ810L3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChfrQ810L3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChfrQ810L3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ChfrQ810L3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChfrQ810L3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChfrQ810L3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ChfrQ810L3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ChfrQ810L3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ChfrQ810L3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ChfrQ810L3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ChfrQ810L3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ChfrQ810L3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ChfrQ810L3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ChfrQ810L3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChfrQ810L3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChfrQ810L3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChfrQ810L3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChfrQ810L3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ChfrQ810L3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ChfrQ810L3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ChfrQ810L3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ChfrQ810L3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ChfrQ810L3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms