Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNS5

B630019K06Rik, RIKEN cDNA B630019K06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B630019K06RikQ7TNS5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B630019K06RikQ7TNS5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
B630019K06RikQ7TNS5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
B630019K06RikQ7TNS5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
B630019K06RikQ7TNS5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B630019K06RikQ7TNS5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
B630019K06RikQ7TNS5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B630019K06RikQ7TNS5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B630019K06RikQ7TNS5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B630019K06RikQ7TNS5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
B630019K06RikQ7TNS5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
B630019K06RikQ7TNS5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B630019K06RikQ7TNS5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
B630019K06RikQ7TNS5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
B630019K06RikQ7TNS5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
B630019K06RikQ7TNS5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
B630019K06RikQ7TNS5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
B630019K06RikQ7TNS5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
B630019K06RikQ7TNS5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
B630019K06RikQ7TNS5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B630019K06RikQ7TNS5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B630019K06RikQ7TNS5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
B630019K06RikQ7TNS5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B630019K06RikQ7TNS5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
B630019K06RikQ7TNS5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
B630019K06RikQ7TNS5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B630019K06RikQ7TNS5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B630019K06RikQ7TNS5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
B630019K06RikQ7TNS5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
B630019K06RikQ7TNS5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
B630019K06RikQ7TNS5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
B630019K06RikQ7TNS5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B630019K06RikQ7TNS5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B630019K06RikQ7TNS5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B630019K06RikQ7TNS5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
B630019K06RikQ7TNS5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B630019K06RikQ7TNS5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
B630019K06RikQ7TNS5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
B630019K06RikQ7TNS5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
B630019K06RikQ7TNS5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
B630019K06RikQ7TNS5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
B630019K06RikQ7TNS5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
B630019K06RikQ7TNS5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
B630019K06RikQ7TNS5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
B630019K06RikQ7TNS5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B630019K06RikQ7TNS5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B630019K06RikQ7TNS5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
B630019K06RikQ7TNS5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
B630019K06RikQ7TNS5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
B630019K06RikQ7TNS5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
B630019K06RikQ7TNS5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
B630019K06RikQ7TNS5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
B630019K06RikQ7TNS5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
B630019K06RikQ7TNS5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B630019K06RikQ7TNS5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
B630019K06RikQ7TNS5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22■■□□□ 1.11
B630019K06RikQ7TNS5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
B630019K06RikQ7TNS5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
B630019K06RikQ7TNS5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
B630019K06RikQ7TNS5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B630019K06RikQ7TNS5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B630019K06RikQ7TNS5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
B630019K06RikQ7TNS5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B630019K06RikQ7TNS5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
B630019K06RikQ7TNS5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B630019K06RikQ7TNS5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
B630019K06RikQ7TNS5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
B630019K06RikQ7TNS5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
B630019K06RikQ7TNS5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
B630019K06RikQ7TNS5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
B630019K06RikQ7TNS5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
B630019K06RikQ7TNS5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms