Protein–RNA interactions for Protein: Q7M764

Usp17le, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein E, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17leQ7M764 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp17leQ7M764 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Usp17leQ7M764 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp17leQ7M764 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp17leQ7M764 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp17leQ7M764 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp17leQ7M764 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp17leQ7M764 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp17leQ7M764 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp17leQ7M764 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp17leQ7M764 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp17leQ7M764 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp17leQ7M764 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp17leQ7M764 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp17leQ7M764 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp17leQ7M764 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp17leQ7M764 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp17leQ7M764 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp17leQ7M764 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp17leQ7M764 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp17leQ7M764 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp17leQ7M764 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Usp17leQ7M764 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Usp17leQ7M764 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Usp17leQ7M764 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp17leQ7M764 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Usp17leQ7M764 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Usp17leQ7M764 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Usp17leQ7M764 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Usp17leQ7M764 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp17leQ7M764 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Usp17leQ7M764 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Usp17leQ7M764 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms