Protein–RNA interactions for Protein: Q7M760

Zranb1, Ubiquitin thioesterase Zranb1, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zranb1Q7M760 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Zranb1Q7M760 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Zranb1Q7M760 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Zranb1Q7M760 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
Zranb1Q7M760 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
Zranb1Q7M760 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Zranb1Q7M760 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Zranb1Q7M760 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Zranb1Q7M760 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Zranb1Q7M760 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Zranb1Q7M760 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
Zranb1Q7M760 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Zranb1Q7M760 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Zranb1Q7M760 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Zranb1Q7M760 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Zranb1Q7M760 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Zranb1Q7M760 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Zranb1Q7M760 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Zranb1Q7M760 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Zranb1Q7M760 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Zranb1Q7M760 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Zranb1Q7M760 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Zranb1Q7M760 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Zranb1Q7M760 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Zranb1Q7M760 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Zranb1Q7M760 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Zranb1Q7M760 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Zranb1Q7M760 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Zranb1Q7M760 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Zranb1Q7M760 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Zranb1Q7M760 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Zranb1Q7M760 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Zranb1Q7M760 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Zranb1Q7M760 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Zranb1Q7M760 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.25
Zranb1Q7M760 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Zranb1Q7M760 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Zranb1Q7M760 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Zranb1Q7M760 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Zranb1Q7M760 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Zranb1Q7M760 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
Zranb1Q7M760 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Zranb1Q7M760 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Zranb1Q7M760 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Zranb1Q7M760 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Zranb1Q7M760 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Zranb1Q7M760 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
Zranb1Q7M760 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Zranb1Q7M760 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Zranb1Q7M760 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Zranb1Q7M760 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Zranb1Q7M760 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Zranb1Q7M760 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC35.16■■■■□ 3.22
Zranb1Q7M760 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Zranb1Q7M760 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Zranb1Q7M760 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
Zranb1Q7M760 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Zranb1Q7M760 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Zranb1Q7M760 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Zranb1Q7M760 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Zranb1Q7M760 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Zranb1Q7M760 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Zranb1Q7M760 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Zranb1Q7M760 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Zranb1Q7M760 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Zranb1Q7M760 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Zranb1Q7M760 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Zranb1Q7M760 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Zranb1Q7M760 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Zranb1Q7M760 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Zranb1Q7M760 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Zranb1Q7M760 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Zranb1Q7M760 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Zranb1Q7M760 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Zranb1Q7M760 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Zranb1Q7M760 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.94■■■■□ 3.18
Zranb1Q7M760 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Zranb1Q7M760 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Zranb1Q7M760 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Zranb1Q7M760 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Zranb1Q7M760 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Zranb1Q7M760 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Zranb1Q7M760 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Zranb1Q7M760 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Zranb1Q7M760 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Zranb1Q7M760 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Zranb1Q7M760 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Zranb1Q7M760 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Zranb1Q7M760 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Zranb1Q7M760 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Zranb1Q7M760 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Zranb1Q7M760 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Zranb1Q7M760 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Zranb1Q7M760 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Zranb1Q7M760 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Zranb1Q7M760 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Zranb1Q7M760 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Zranb1Q7M760 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Zranb1Q7M760 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Zranb1Q7M760 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms