Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Smim12Q78RX3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Smim12Q78RX3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim12Q78RX3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Smim12Q78RX3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim12Q78RX3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim12Q78RX3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Smim12Q78RX3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smim12Q78RX3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim12Q78RX3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim12Q78RX3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smim12Q78RX3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim12Q78RX3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smim12Q78RX3 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smim12Q78RX3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim12Q78RX3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smim12Q78RX3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim12Q78RX3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smim12Q78RX3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smim12Q78RX3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim12Q78RX3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim12Q78RX3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim12Q78RX3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smim12Q78RX3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim12Q78RX3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim12Q78RX3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim12Q78RX3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smim12Q78RX3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Smim12Q78RX3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smim12Q78RX3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smim12Q78RX3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim12Q78RX3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim12Q78RX3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smim12Q78RX3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smim12Q78RX3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Smim12Q78RX3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Smim12Q78RX3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smim12Q78RX3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Smim12Q78RX3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Smim12Q78RX3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms