Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tcaf3Q6QR59 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Tcaf3Q6QR59 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tcaf3Q6QR59 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tcaf3Q6QR59 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Tcaf3Q6QR59 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Tcaf3Q6QR59 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Tcaf3Q6QR59 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tcaf3Q6QR59 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tcaf3Q6QR59 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tcaf3Q6QR59 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Tcaf3Q6QR59 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Tcaf3Q6QR59 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tcaf3Q6QR59 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tcaf3Q6QR59 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Tcaf3Q6QR59 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Tcaf3Q6QR59 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tcaf3Q6QR59 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tcaf3Q6QR59 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tcaf3Q6QR59 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tcaf3Q6QR59 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tcaf3Q6QR59 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tcaf3Q6QR59 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tcaf3Q6QR59 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Tcaf3Q6QR59 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tcaf3Q6QR59 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tcaf3Q6QR59 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tcaf3Q6QR59 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tcaf3Q6QR59 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tcaf3Q6QR59 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcaf3Q6QR59 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tcaf3Q6QR59 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tcaf3Q6QR59 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcaf3Q6QR59 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tcaf3Q6QR59 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Tcaf3Q6QR59 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tcaf3Q6QR59 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Tcaf3Q6QR59 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tcaf3Q6QR59 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tcaf3Q6QR59 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tcaf3Q6QR59 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tcaf3Q6QR59 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tcaf3Q6QR59 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Tcaf3Q6QR59 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tcaf3Q6QR59 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tcaf3Q6QR59 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tcaf3Q6QR59 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tcaf3Q6QR59 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tcaf3Q6QR59 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tcaf3Q6QR59 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tcaf3Q6QR59 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tcaf3Q6QR59 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tcaf3Q6QR59 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tcaf3Q6QR59 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tcaf3Q6QR59 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tcaf3Q6QR59 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tcaf3Q6QR59 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tcaf3Q6QR59 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tcaf3Q6QR59 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tcaf3Q6QR59 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tcaf3Q6QR59 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tcaf3Q6QR59 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tcaf3Q6QR59 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tcaf3Q6QR59 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tcaf3Q6QR59 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tcaf3Q6QR59 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tcaf3Q6QR59 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tcaf3Q6QR59 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tcaf3Q6QR59 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tcaf3Q6QR59 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tcaf3Q6QR59 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tcaf3Q6QR59 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tcaf3Q6QR59 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tcaf3Q6QR59 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tcaf3Q6QR59 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tcaf3Q6QR59 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tcaf3Q6QR59 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tcaf3Q6QR59 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tcaf3Q6QR59 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tcaf3Q6QR59 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tcaf3Q6QR59 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tcaf3Q6QR59 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Tcaf3Q6QR59 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tcaf3Q6QR59 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tcaf3Q6QR59 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Tcaf3Q6QR59 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms