Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDQ2

Chd4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd4Q6PDQ2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Chd4Q6PDQ2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Chd4Q6PDQ2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Chd4Q6PDQ2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Chd4Q6PDQ2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Chd4Q6PDQ2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Chd4Q6PDQ2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Chd4Q6PDQ2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Chd4Q6PDQ2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Chd4Q6PDQ2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Chd4Q6PDQ2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
Chd4Q6PDQ2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Chd4Q6PDQ2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Chd4Q6PDQ2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Chd4Q6PDQ2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Chd4Q6PDQ2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Chd4Q6PDQ2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Chd4Q6PDQ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Chd4Q6PDQ2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Chd4Q6PDQ2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Chd4Q6PDQ2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Chd4Q6PDQ2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Chd4Q6PDQ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Chd4Q6PDQ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Chd4Q6PDQ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Chd4Q6PDQ2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Chd4Q6PDQ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Chd4Q6PDQ2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Chd4Q6PDQ2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Chd4Q6PDQ2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Chd4Q6PDQ2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Chd4Q6PDQ2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Chd4Q6PDQ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Chd4Q6PDQ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Chd4Q6PDQ2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Chd4Q6PDQ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Chd4Q6PDQ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Chd4Q6PDQ2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Chd4Q6PDQ2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Chd4Q6PDQ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Chd4Q6PDQ2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Chd4Q6PDQ2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Chd4Q6PDQ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Chd4Q6PDQ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
Chd4Q6PDQ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Chd4Q6PDQ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Chd4Q6PDQ2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Chd4Q6PDQ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Chd4Q6PDQ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Chd4Q6PDQ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Chd4Q6PDQ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Chd4Q6PDQ2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Chd4Q6PDQ2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Chd4Q6PDQ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Chd4Q6PDQ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Chd4Q6PDQ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Chd4Q6PDQ2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Chd4Q6PDQ2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Chd4Q6PDQ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Chd4Q6PDQ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Chd4Q6PDQ2 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Chd4Q6PDQ2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
Chd4Q6PDQ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Chd4Q6PDQ2 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Chd4Q6PDQ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Chd4Q6PDQ2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Chd4Q6PDQ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Chd4Q6PDQ2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Chd4Q6PDQ2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Chd4Q6PDQ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Chd4Q6PDQ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Chd4Q6PDQ2 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Chd4Q6PDQ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Chd4Q6PDQ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Chd4Q6PDQ2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Chd4Q6PDQ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Chd4Q6PDQ2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Chd4Q6PDQ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Chd4Q6PDQ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Chd4Q6PDQ2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Chd4Q6PDQ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Chd4Q6PDQ2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Chd4Q6PDQ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Chd4Q6PDQ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Chd4Q6PDQ2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Chd4Q6PDQ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Chd4Q6PDQ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Chd4Q6PDQ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Chd4Q6PDQ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Chd4Q6PDQ2 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Chd4Q6PDQ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Chd4Q6PDQ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Chd4Q6PDQ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Chd4Q6PDQ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Chd4Q6PDQ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Chd4Q6PDQ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Chd4Q6PDQ2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Chd4Q6PDQ2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Chd4Q6PDQ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Chd4Q6PDQ2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms