Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9N8

Trak2, Trafficking protein, kinesin-binding 2, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak2Q6P9N8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Trak2Q6P9N8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trak2Q6P9N8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Trak2Q6P9N8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trak2Q6P9N8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak2Q6P9N8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak2Q6P9N8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak2Q6P9N8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak2Q6P9N8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak2Q6P9N8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trak2Q6P9N8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trak2Q6P9N8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trak2Q6P9N8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trak2Q6P9N8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Trak2Q6P9N8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trak2Q6P9N8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trak2Q6P9N8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Trak2Q6P9N8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Trak2Q6P9N8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak2Q6P9N8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak2Q6P9N8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak2Q6P9N8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak2Q6P9N8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trak2Q6P9N8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trak2Q6P9N8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trak2Q6P9N8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trak2Q6P9N8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trak2Q6P9N8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Trak2Q6P9N8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trak2Q6P9N8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trak2Q6P9N8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Trak2Q6P9N8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trak2Q6P9N8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trak2Q6P9N8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Trak2Q6P9N8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Trak2Q6P9N8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trak2Q6P9N8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trak2Q6P9N8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trak2Q6P9N8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trak2Q6P9N8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Trak2Q6P9N8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trak2Q6P9N8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trak2Q6P9N8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trak2Q6P9N8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trak2Q6P9N8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trak2Q6P9N8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Trak2Q6P9N8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trak2Q6P9N8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Trak2Q6P9N8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trak2Q6P9N8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trak2Q6P9N8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trak2Q6P9N8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trak2Q6P9N8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trak2Q6P9N8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Trak2Q6P9N8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trak2Q6P9N8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trak2Q6P9N8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trak2Q6P9N8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trak2Q6P9N8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trak2Q6P9N8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trak2Q6P9N8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trak2Q6P9N8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Trak2Q6P9N8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Trak2Q6P9N8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trak2Q6P9N8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trak2Q6P9N8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trak2Q6P9N8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trak2Q6P9N8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trak2Q6P9N8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trak2Q6P9N8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trak2Q6P9N8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trak2Q6P9N8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trak2Q6P9N8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trak2Q6P9N8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trak2Q6P9N8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trak2Q6P9N8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trak2Q6P9N8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trak2Q6P9N8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trak2Q6P9N8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trak2Q6P9N8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trak2Q6P9N8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trak2Q6P9N8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trak2Q6P9N8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trak2Q6P9N8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trak2Q6P9N8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trak2Q6P9N8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms