Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K8

Cpa4, Carboxypeptidase A4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa4Q6P8K8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cpa4Q6P8K8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cpa4Q6P8K8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cpa4Q6P8K8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cpa4Q6P8K8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cpa4Q6P8K8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cpa4Q6P8K8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cpa4Q6P8K8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cpa4Q6P8K8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Cpa4Q6P8K8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cpa4Q6P8K8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Cpa4Q6P8K8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cpa4Q6P8K8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cpa4Q6P8K8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cpa4Q6P8K8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cpa4Q6P8K8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cpa4Q6P8K8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Cpa4Q6P8K8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cpa4Q6P8K8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cpa4Q6P8K8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cpa4Q6P8K8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cpa4Q6P8K8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cpa4Q6P8K8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cpa4Q6P8K8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cpa4Q6P8K8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Cpa4Q6P8K8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cpa4Q6P8K8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cpa4Q6P8K8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cpa4Q6P8K8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cpa4Q6P8K8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cpa4Q6P8K8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cpa4Q6P8K8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cpa4Q6P8K8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cpa4Q6P8K8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cpa4Q6P8K8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cpa4Q6P8K8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cpa4Q6P8K8 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Cpa4Q6P8K8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cpa4Q6P8K8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cpa4Q6P8K8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cpa4Q6P8K8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Cpa4Q6P8K8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpa4Q6P8K8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cpa4Q6P8K8 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cpa4Q6P8K8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cpa4Q6P8K8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Cpa4Q6P8K8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cpa4Q6P8K8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cpa4Q6P8K8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cpa4Q6P8K8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cpa4Q6P8K8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cpa4Q6P8K8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cpa4Q6P8K8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cpa4Q6P8K8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Cpa4Q6P8K8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cpa4Q6P8K8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Cpa4Q6P8K8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cpa4Q6P8K8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cpa4Q6P8K8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cpa4Q6P8K8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cpa4Q6P8K8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cpa4Q6P8K8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Cpa4Q6P8K8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cpa4Q6P8K8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cpa4Q6P8K8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cpa4Q6P8K8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cpa4Q6P8K8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cpa4Q6P8K8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cpa4Q6P8K8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cpa4Q6P8K8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cpa4Q6P8K8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cpa4Q6P8K8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cpa4Q6P8K8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cpa4Q6P8K8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cpa4Q6P8K8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cpa4Q6P8K8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Cpa4Q6P8K8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cpa4Q6P8K8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.7 ms