Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5G6

Ubxn7, UBX domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn7Q6P5G6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ubxn7Q6P5G6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn7Q6P5G6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ubxn7Q6P5G6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn7Q6P5G6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn7Q6P5G6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ubxn7Q6P5G6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ubxn7Q6P5G6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn7Q6P5G6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn7Q6P5G6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ubxn7Q6P5G6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ubxn7Q6P5G6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ubxn7Q6P5G6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn7Q6P5G6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ubxn7Q6P5G6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ubxn7Q6P5G6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn7Q6P5G6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ubxn7Q6P5G6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn7Q6P5G6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ubxn7Q6P5G6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn7Q6P5G6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ubxn7Q6P5G6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ubxn7Q6P5G6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn7Q6P5G6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn7Q6P5G6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ubxn7Q6P5G6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn7Q6P5G6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ubxn7Q6P5G6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn7Q6P5G6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ubxn7Q6P5G6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn7Q6P5G6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn7Q6P5G6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ubxn7Q6P5G6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ubxn7Q6P5G6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ubxn7Q6P5G6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn7Q6P5G6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ubxn7Q6P5G6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ubxn7Q6P5G6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn7Q6P5G6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ubxn7Q6P5G6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn7Q6P5G6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ubxn7Q6P5G6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn7Q6P5G6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ubxn7Q6P5G6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ubxn7Q6P5G6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Ubxn7Q6P5G6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ubxn7Q6P5G6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ubxn7Q6P5G6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn7Q6P5G6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn7Q6P5G6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ubxn7Q6P5G6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ubxn7Q6P5G6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ubxn7Q6P5G6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn7Q6P5G6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn7Q6P5G6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ubxn7Q6P5G6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn7Q6P5G6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn7Q6P5G6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ubxn7Q6P5G6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn7Q6P5G6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn7Q6P5G6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ubxn7Q6P5G6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ubxn7Q6P5G6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn7Q6P5G6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn7Q6P5G6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn7Q6P5G6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ubxn7Q6P5G6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ubxn7Q6P5G6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ubxn7Q6P5G6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ubxn7Q6P5G6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn7Q6P5G6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ubxn7Q6P5G6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ubxn7Q6P5G6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ubxn7Q6P5G6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn7Q6P5G6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ubxn7Q6P5G6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn7Q6P5G6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ubxn7Q6P5G6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn7Q6P5G6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn7Q6P5G6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ubxn7Q6P5G6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms