Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXI6

Rprd2, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd2Q6NXI6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Rprd2Q6NXI6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC37.18■■■■□ 3.54
Rprd2Q6NXI6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rprd2Q6NXI6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rprd2Q6NXI6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
Rprd2Q6NXI6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
Rprd2Q6NXI6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Rprd2Q6NXI6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Rprd2Q6NXI6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Rprd2Q6NXI6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rprd2Q6NXI6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rprd2Q6NXI6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Rprd2Q6NXI6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rprd2Q6NXI6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rprd2Q6NXI6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Rprd2Q6NXI6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rprd2Q6NXI6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rprd2Q6NXI6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rprd2Q6NXI6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rprd2Q6NXI6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rprd2Q6NXI6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Rprd2Q6NXI6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Rprd2Q6NXI6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
Rprd2Q6NXI6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
Rprd2Q6NXI6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rprd2Q6NXI6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rprd2Q6NXI6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rprd2Q6NXI6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rprd2Q6NXI6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
Rprd2Q6NXI6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Rprd2Q6NXI6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rprd2Q6NXI6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rprd2Q6NXI6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rprd2Q6NXI6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Rprd2Q6NXI6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rprd2Q6NXI6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rprd2Q6NXI6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rprd2Q6NXI6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rprd2Q6NXI6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rprd2Q6NXI6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rprd2Q6NXI6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rprd2Q6NXI6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rprd2Q6NXI6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Rprd2Q6NXI6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC36.84■■■■□ 3.49
Rprd2Q6NXI6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Rprd2Q6NXI6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36.79■■■■□ 3.48
Rprd2Q6NXI6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rprd2Q6NXI6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rprd2Q6NXI6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Rprd2Q6NXI6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rprd2Q6NXI6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Rprd2Q6NXI6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Rprd2Q6NXI6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rprd2Q6NXI6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rprd2Q6NXI6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rprd2Q6NXI6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Rprd2Q6NXI6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rprd2Q6NXI6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rprd2Q6NXI6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Rprd2Q6NXI6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Rprd2Q6NXI6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
Rprd2Q6NXI6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Rprd2Q6NXI6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Rprd2Q6NXI6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rprd2Q6NXI6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
Rprd2Q6NXI6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
Rprd2Q6NXI6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Rprd2Q6NXI6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rprd2Q6NXI6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rprd2Q6NXI6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Rprd2Q6NXI6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rprd2Q6NXI6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Rprd2Q6NXI6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rprd2Q6NXI6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rprd2Q6NXI6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rprd2Q6NXI6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Rprd2Q6NXI6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Rprd2Q6NXI6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Rprd2Q6NXI6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rprd2Q6NXI6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rprd2Q6NXI6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rprd2Q6NXI6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rprd2Q6NXI6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Rprd2Q6NXI6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Rprd2Q6NXI6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rprd2Q6NXI6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rprd2Q6NXI6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rprd2Q6NXI6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rprd2Q6NXI6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rprd2Q6NXI6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rprd2Q6NXI6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rprd2Q6NXI6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Rprd2Q6NXI6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rprd2Q6NXI6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rprd2Q6NXI6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Rprd2Q6NXI6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rprd2Q6NXI6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rprd2Q6NXI6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Rprd2Q6NXI6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rprd2Q6NXI6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms