Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.09■■■■■ 4.65
Top2bQ64511 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC44.09■■■■■ 4.65
Top2bQ64511 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
Top2bQ64511 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC44.07■■■■■ 4.65
Top2bQ64511 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.06■■■■■ 4.64
Top2bQ64511 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.05■■■■■ 4.64
Top2bQ64511 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.03■■■■■ 4.64
Top2bQ64511 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.02■■■■■ 4.64
Top2bQ64511 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
Top2bQ64511 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC43.99■■■■■ 4.63
Top2bQ64511 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC43.97■■■■■ 4.63
Top2bQ64511 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC43.96■■■■■ 4.63
Top2bQ64511 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.96■■■■■ 4.63
Top2bQ64511 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.94■■■■■ 4.62
Top2bQ64511 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC43.93■■■■■ 4.62
Top2bQ64511 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Top2bQ64511 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Top2bQ64511 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Top2bQ64511 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Top2bQ64511 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC43.91■■■■■ 4.62
Top2bQ64511 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
Top2bQ64511 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC43.87■■■■■ 4.61
Top2bQ64511 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Top2bQ64511 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Top2bQ64511 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
Top2bQ64511 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC43.81■■■■■ 4.6
Top2bQ64511 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
Top2bQ64511 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
Top2bQ64511 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Top2bQ64511 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
Top2bQ64511 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
Top2bQ64511 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
Top2bQ64511 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.7■■■■■ 4.59
Top2bQ64511 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
Top2bQ64511 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
Top2bQ64511 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Top2bQ64511 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
Top2bQ64511 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
Top2bQ64511 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
Top2bQ64511 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
Top2bQ64511 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
Top2bQ64511 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC43.58■■■■■ 4.57
Top2bQ64511 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC43.58■■■■■ 4.57
Top2bQ64511 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
Top2bQ64511 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.56
Top2bQ64511 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC43.56■■■■■ 4.56
Top2bQ64511 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Top2bQ64511 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
Top2bQ64511 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC43.51■■■■■ 4.56
Top2bQ64511 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
Top2bQ64511 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Top2bQ64511 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
Top2bQ64511 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Top2bQ64511 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Top2bQ64511 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Top2bQ64511 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
Top2bQ64511 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Top2bQ64511 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
Top2bQ64511 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
Top2bQ64511 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
Top2bQ64511 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC43.39■■■■■ 4.54
Top2bQ64511 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Top2bQ64511 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Top2bQ64511 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Top2bQ64511 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Top2bQ64511 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Top2bQ64511 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Top2bQ64511 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
Top2bQ64511 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Top2bQ64511 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
Top2bQ64511 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Top2bQ64511 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Top2bQ64511 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
Top2bQ64511 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Top2bQ64511 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
Top2bQ64511 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
Top2bQ64511 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
Top2bQ64511 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
Top2bQ64511 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Top2bQ64511 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Top2bQ64511 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Top2bQ64511 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
Top2bQ64511 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC43.14■■■■■ 4.5
Top2bQ64511 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
Top2bQ64511 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.12■■■■■ 4.49
Top2bQ64511 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Top2bQ64511 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Top2bQ64511 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
Top2bQ64511 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
Top2bQ64511 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
Top2bQ64511 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
Top2bQ64511 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC43.04■■■■■ 4.48
Top2bQ64511 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
Top2bQ64511 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
Top2bQ64511 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Top2bQ64511 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
Top2bQ64511 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
Top2bQ64511 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.01■■■■■ 4.48
Top2bQ64511 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Top2bQ64511 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms