Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rai1Q61818 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rai1Q61818 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rai1Q61818 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rai1Q61818 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rai1Q61818 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rai1Q61818 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rai1Q61818 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rai1Q61818 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rai1Q61818 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rai1Q61818 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rai1Q61818 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rai1Q61818 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rai1Q61818 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rai1Q61818 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rai1Q61818 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rai1Q61818 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rai1Q61818 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rai1Q61818 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rai1Q61818 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rai1Q61818 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rai1Q61818 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rai1Q61818 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rai1Q61818 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rai1Q61818 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rai1Q61818 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Rai1Q61818 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rai1Q61818 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rai1Q61818 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rai1Q61818 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rai1Q61818 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rai1Q61818 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rai1Q61818 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rai1Q61818 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rai1Q61818 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rai1Q61818 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Rai1Q61818 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rai1Q61818 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rai1Q61818 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rai1Q61818 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rai1Q61818 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rai1Q61818 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rai1Q61818 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rai1Q61818 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rai1Q61818 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rai1Q61818 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rai1Q61818 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rai1Q61818 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rai1Q61818 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rai1Q61818 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rai1Q61818 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rai1Q61818 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rai1Q61818 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rai1Q61818 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rai1Q61818 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rai1Q61818 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rai1Q61818 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rai1Q61818 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rai1Q61818 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rai1Q61818 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rai1Q61818 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rai1Q61818 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rai1Q61818 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rai1Q61818 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Rai1Q61818 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rai1Q61818 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rai1Q61818 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rai1Q61818 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rai1Q61818 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rai1Q61818 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rai1Q61818 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rai1Q61818 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rai1Q61818 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rai1Q61818 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rai1Q61818 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rai1Q61818 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Rai1Q61818 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rai1Q61818 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rai1Q61818 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rai1Q61818 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rai1Q61818 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rai1Q61818 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rai1Q61818 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rai1Q61818 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rai1Q61818 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rai1Q61818 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms