Protein–RNA interactions for Protein: Q61371

Ift88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift88Q61371 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ift88Q61371 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ift88Q61371 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ift88Q61371 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ift88Q61371 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ift88Q61371 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ift88Q61371 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ift88Q61371 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ift88Q61371 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ift88Q61371 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ift88Q61371 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ift88Q61371 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ift88Q61371 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ift88Q61371 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ift88Q61371 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ift88Q61371 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ift88Q61371 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ift88Q61371 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ift88Q61371 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ift88Q61371 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ift88Q61371 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ift88Q61371 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ift88Q61371 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ift88Q61371 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift88Q61371 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ift88Q61371 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift88Q61371 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ift88Q61371 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ift88Q61371 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ift88Q61371 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Ift88Q61371 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ift88Q61371 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ift88Q61371 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ift88Q61371 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ift88Q61371 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ift88Q61371 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ift88Q61371 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Ift88Q61371 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift88Q61371 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift88Q61371 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ift88Q61371 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ift88Q61371 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ift88Q61371 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ift88Q61371 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ift88Q61371 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ift88Q61371 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ift88Q61371 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ift88Q61371 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ift88Q61371 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ift88Q61371 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ift88Q61371 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ift88Q61371 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ift88Q61371 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ift88Q61371 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ift88Q61371 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ift88Q61371 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ift88Q61371 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ift88Q61371 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ift88Q61371 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ift88Q61371 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ift88Q61371 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
Ift88Q61371 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ift88Q61371 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ift88Q61371 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Ift88Q61371 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ift88Q61371 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ift88Q61371 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ift88Q61371 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ift88Q61371 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ift88Q61371 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ift88Q61371 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ift88Q61371 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ift88Q61371 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ift88Q61371 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ift88Q61371 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ift88Q61371 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Ift88Q61371 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ift88Q61371 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ift88Q61371 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ift88Q61371 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ift88Q61371 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
Ift88Q61371 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ift88Q61371 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ift88Q61371 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Ift88Q61371 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ift88Q61371 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ift88Q61371 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Ift88Q61371 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ift88Q61371 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ift88Q61371 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ift88Q61371 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ift88Q61371 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ift88Q61371 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ift88Q61371 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ift88Q61371 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ift88Q61371 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ift88Q61371 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ift88Q61371 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ift88Q61371 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ift88Q61371 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms