Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
JrkQ60976 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
JrkQ60976 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
JrkQ60976 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
JrkQ60976 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
JrkQ60976 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
JrkQ60976 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JrkQ60976 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
JrkQ60976 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JrkQ60976 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
JrkQ60976 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JrkQ60976 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
JrkQ60976 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
JrkQ60976 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
JrkQ60976 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
JrkQ60976 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JrkQ60976 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
JrkQ60976 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JrkQ60976 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JrkQ60976 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
JrkQ60976 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
JrkQ60976 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JrkQ60976 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
JrkQ60976 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
JrkQ60976 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
JrkQ60976 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
JrkQ60976 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JrkQ60976 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
JrkQ60976 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
JrkQ60976 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
JrkQ60976 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
JrkQ60976 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JrkQ60976 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JrkQ60976 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JrkQ60976 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
JrkQ60976 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
JrkQ60976 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
JrkQ60976 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
JrkQ60976 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
JrkQ60976 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
JrkQ60976 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
JrkQ60976 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
JrkQ60976 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
JrkQ60976 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
JrkQ60976 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
JrkQ60976 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JrkQ60976 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
JrkQ60976 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
JrkQ60976 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
JrkQ60976 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
JrkQ60976 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
JrkQ60976 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JrkQ60976 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JrkQ60976 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JrkQ60976 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JrkQ60976 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JrkQ60976 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
JrkQ60976 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
JrkQ60976 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
JrkQ60976 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
JrkQ60976 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JrkQ60976 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
JrkQ60976 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JrkQ60976 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JrkQ60976 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
JrkQ60976 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JrkQ60976 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JrkQ60976 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
JrkQ60976 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
JrkQ60976 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
JrkQ60976 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
JrkQ60976 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms