Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
Neurod1Q60867 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Neurod1Q60867 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Neurod1Q60867 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Neurod1Q60867 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC36.91■■■■□ 3.5
Neurod1Q60867 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
Neurod1Q60867 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Neurod1Q60867 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Neurod1Q60867 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Neurod1Q60867 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Neurod1Q60867 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
Neurod1Q60867 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Neurod1Q60867 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Neurod1Q60867 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Neurod1Q60867 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Neurod1Q60867 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Neurod1Q60867 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
Neurod1Q60867 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
Neurod1Q60867 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.79■■■■□ 3.48
Neurod1Q60867 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.78■■■■□ 3.48
Neurod1Q60867 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
Neurod1Q60867 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Neurod1Q60867 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Neurod1Q60867 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Neurod1Q60867 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Neurod1Q60867 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Neurod1Q60867 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Neurod1Q60867 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Neurod1Q60867 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Neurod1Q60867 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Neurod1Q60867 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Neurod1Q60867 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Neurod1Q60867 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Neurod1Q60867 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.69■■■■□ 3.46
Neurod1Q60867 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Neurod1Q60867 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Neurod1Q60867 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
Neurod1Q60867 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
Neurod1Q60867 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
Neurod1Q60867 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Neurod1Q60867 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Neurod1Q60867 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Neurod1Q60867 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Neurod1Q60867 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Neurod1Q60867 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Neurod1Q60867 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
Neurod1Q60867 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Neurod1Q60867 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Neurod1Q60867 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Neurod1Q60867 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Neurod1Q60867 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Neurod1Q60867 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Neurod1Q60867 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Neurod1Q60867 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
Neurod1Q60867 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Neurod1Q60867 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Neurod1Q60867 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Neurod1Q60867 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Neurod1Q60867 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Neurod1Q60867 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Neurod1Q60867 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Neurod1Q60867 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Neurod1Q60867 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Neurod1Q60867 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Neurod1Q60867 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Neurod1Q60867 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Neurod1Q60867 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Neurod1Q60867 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Neurod1Q60867 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Neurod1Q60867 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
Neurod1Q60867 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Neurod1Q60867 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Neurod1Q60867 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Neurod1Q60867 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Neurod1Q60867 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Neurod1Q60867 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Neurod1Q60867 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Neurod1Q60867 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Neurod1Q60867 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Neurod1Q60867 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Neurod1Q60867 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Neurod1Q60867 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
Neurod1Q60867 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Neurod1Q60867 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
Neurod1Q60867 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
Neurod1Q60867 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Neurod1Q60867 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Neurod1Q60867 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Neurod1Q60867 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Neurod1Q60867 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Neurod1Q60867 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Neurod1Q60867 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Neurod1Q60867 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Neurod1Q60867 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Neurod1Q60867 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Neurod1Q60867 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Neurod1Q60867 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Neurod1Q60867 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Neurod1Q60867 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Neurod1Q60867 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms