Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Tnfsf15Q5UBV8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tnfsf15Q5UBV8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf15Q5UBV8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Tnfsf15Q5UBV8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tnfsf15Q5UBV8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Tnfsf15Q5UBV8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Tnfsf15Q5UBV8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Tnfsf15Q5UBV8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tnfsf15Q5UBV8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tnfsf15Q5UBV8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100 ms