Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZJ0

Drosha, Ribonuclease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DroshaQ5HZJ0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
DroshaQ5HZJ0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
DroshaQ5HZJ0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
DroshaQ5HZJ0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
DroshaQ5HZJ0 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
DroshaQ5HZJ0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37.66■■■■□ 3.62
DroshaQ5HZJ0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
DroshaQ5HZJ0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
DroshaQ5HZJ0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.63■■■■□ 3.61
DroshaQ5HZJ0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
DroshaQ5HZJ0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
DroshaQ5HZJ0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
DroshaQ5HZJ0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
DroshaQ5HZJ0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
DroshaQ5HZJ0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
DroshaQ5HZJ0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
DroshaQ5HZJ0 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
DroshaQ5HZJ0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
DroshaQ5HZJ0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
DroshaQ5HZJ0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
DroshaQ5HZJ0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
DroshaQ5HZJ0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
DroshaQ5HZJ0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
DroshaQ5HZJ0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
DroshaQ5HZJ0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
DroshaQ5HZJ0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
DroshaQ5HZJ0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
DroshaQ5HZJ0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
DroshaQ5HZJ0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
DroshaQ5HZJ0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
DroshaQ5HZJ0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
DroshaQ5HZJ0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
DroshaQ5HZJ0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
DroshaQ5HZJ0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
DroshaQ5HZJ0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
DroshaQ5HZJ0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC37.28■■■■□ 3.56
DroshaQ5HZJ0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
DroshaQ5HZJ0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
DroshaQ5HZJ0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
DroshaQ5HZJ0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
DroshaQ5HZJ0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
DroshaQ5HZJ0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
DroshaQ5HZJ0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
DroshaQ5HZJ0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
DroshaQ5HZJ0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
DroshaQ5HZJ0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
DroshaQ5HZJ0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
DroshaQ5HZJ0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
DroshaQ5HZJ0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
DroshaQ5HZJ0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
DroshaQ5HZJ0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
DroshaQ5HZJ0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DroshaQ5HZJ0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DroshaQ5HZJ0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
DroshaQ5HZJ0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
DroshaQ5HZJ0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
DroshaQ5HZJ0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37.08■■■■□ 3.53
DroshaQ5HZJ0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
DroshaQ5HZJ0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
DroshaQ5HZJ0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
DroshaQ5HZJ0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
DroshaQ5HZJ0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
DroshaQ5HZJ0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
DroshaQ5HZJ0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
DroshaQ5HZJ0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
DroshaQ5HZJ0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
DroshaQ5HZJ0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
DroshaQ5HZJ0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
DroshaQ5HZJ0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC36.94■■■■□ 3.5
DroshaQ5HZJ0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.92■■■■□ 3.5
DroshaQ5HZJ0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
DroshaQ5HZJ0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
DroshaQ5HZJ0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
DroshaQ5HZJ0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
DroshaQ5HZJ0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
DroshaQ5HZJ0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
DroshaQ5HZJ0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
DroshaQ5HZJ0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
DroshaQ5HZJ0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.84■■■■□ 3.49
DroshaQ5HZJ0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
DroshaQ5HZJ0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC36.83■■■■□ 3.49
DroshaQ5HZJ0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
DroshaQ5HZJ0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DroshaQ5HZJ0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
DroshaQ5HZJ0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
DroshaQ5HZJ0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
DroshaQ5HZJ0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DroshaQ5HZJ0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.78■■■■□ 3.48
DroshaQ5HZJ0 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
DroshaQ5HZJ0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
DroshaQ5HZJ0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
DroshaQ5HZJ0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
DroshaQ5HZJ0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
DroshaQ5HZJ0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC36.74■■■■□ 3.47
DroshaQ5HZJ0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
DroshaQ5HZJ0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
DroshaQ5HZJ0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
DroshaQ5HZJ0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
DroshaQ5HZJ0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
DroshaQ5HZJ0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms