Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2L5

Gm904, Gene model 904, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm904Q3V2L5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm904Q3V2L5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm904Q3V2L5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Gm904Q3V2L5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm904Q3V2L5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm904Q3V2L5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gm904Q3V2L5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gm904Q3V2L5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm904Q3V2L5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm904Q3V2L5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm904Q3V2L5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm904Q3V2L5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm904Q3V2L5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm904Q3V2L5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm904Q3V2L5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm904Q3V2L5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm904Q3V2L5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm904Q3V2L5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm904Q3V2L5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm904Q3V2L5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm904Q3V2L5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm904Q3V2L5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm904Q3V2L5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm904Q3V2L5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm904Q3V2L5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm904Q3V2L5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms