Protein–RNA interactions for Protein: Q3USF0

B3gnt6, Acetylgalactosaminyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt6Q3USF0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
B3gnt6Q3USF0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
B3gnt6Q3USF0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3gnt6Q3USF0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
B3gnt6Q3USF0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
B3gnt6Q3USF0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
B3gnt6Q3USF0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
B3gnt6Q3USF0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3gnt6Q3USF0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3gnt6Q3USF0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3gnt6Q3USF0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3gnt6Q3USF0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
B3gnt6Q3USF0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
B3gnt6Q3USF0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
B3gnt6Q3USF0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B3gnt6Q3USF0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B3gnt6Q3USF0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
B3gnt6Q3USF0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B3gnt6Q3USF0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
B3gnt6Q3USF0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
B3gnt6Q3USF0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
B3gnt6Q3USF0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
B3gnt6Q3USF0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
B3gnt6Q3USF0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B3gnt6Q3USF0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B3gnt6Q3USF0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B3gnt6Q3USF0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B3gnt6Q3USF0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
B3gnt6Q3USF0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
B3gnt6Q3USF0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
B3gnt6Q3USF0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
B3gnt6Q3USF0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B3gnt6Q3USF0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B3gnt6Q3USF0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
B3gnt6Q3USF0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
B3gnt6Q3USF0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
B3gnt6Q3USF0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
B3gnt6Q3USF0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
B3gnt6Q3USF0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B3gnt6Q3USF0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
B3gnt6Q3USF0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
B3gnt6Q3USF0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
B3gnt6Q3USF0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
B3gnt6Q3USF0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
B3gnt6Q3USF0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
B3gnt6Q3USF0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms