Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Garem1Q3UFT3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Garem1Q3UFT3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Garem1Q3UFT3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Garem1Q3UFT3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Garem1Q3UFT3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Garem1Q3UFT3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Garem1Q3UFT3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Garem1Q3UFT3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Garem1Q3UFT3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Garem1Q3UFT3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Garem1Q3UFT3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Garem1Q3UFT3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Garem1Q3UFT3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Garem1Q3UFT3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Garem1Q3UFT3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Garem1Q3UFT3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Garem1Q3UFT3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Garem1Q3UFT3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Garem1Q3UFT3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Garem1Q3UFT3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Garem1Q3UFT3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Garem1Q3UFT3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Garem1Q3UFT3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Garem1Q3UFT3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Garem1Q3UFT3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Garem1Q3UFT3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Garem1Q3UFT3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Garem1Q3UFT3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Garem1Q3UFT3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Garem1Q3UFT3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Garem1Q3UFT3 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Garem1Q3UFT3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Garem1Q3UFT3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Garem1Q3UFT3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Garem1Q3UFT3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Garem1Q3UFT3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Garem1Q3UFT3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Garem1Q3UFT3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Garem1Q3UFT3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Garem1Q3UFT3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Garem1Q3UFT3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Garem1Q3UFT3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Garem1Q3UFT3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Garem1Q3UFT3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Garem1Q3UFT3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Garem1Q3UFT3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Garem1Q3UFT3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Garem1Q3UFT3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Garem1Q3UFT3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Garem1Q3UFT3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Garem1Q3UFT3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Garem1Q3UFT3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Garem1Q3UFT3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Garem1Q3UFT3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Garem1Q3UFT3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Garem1Q3UFT3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Garem1Q3UFT3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Garem1Q3UFT3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Garem1Q3UFT3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Garem1Q3UFT3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Garem1Q3UFT3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Garem1Q3UFT3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Garem1Q3UFT3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Garem1Q3UFT3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Garem1Q3UFT3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Garem1Q3UFT3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Garem1Q3UFT3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Garem1Q3UFT3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Garem1Q3UFT3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Garem1Q3UFT3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Garem1Q3UFT3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Garem1Q3UFT3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Garem1Q3UFT3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Garem1Q3UFT3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Garem1Q3UFT3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Garem1Q3UFT3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Garem1Q3UFT3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Garem1Q3UFT3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Garem1Q3UFT3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Garem1Q3UFT3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Garem1Q3UFT3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Garem1Q3UFT3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Garem1Q3UFT3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Garem1Q3UFT3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Garem1Q3UFT3 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Garem1Q3UFT3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Garem1Q3UFT3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Garem1Q3UFT3 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Garem1Q3UFT3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Garem1Q3UFT3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Garem1Q3UFT3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Garem1Q3UFT3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Garem1Q3UFT3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Garem1Q3UFT3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Garem1Q3UFT3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Garem1Q3UFT3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Garem1Q3UFT3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Garem1Q3UFT3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Garem1Q3UFT3 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms