Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4G0

Uncharacterized protein C15orf41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U4G0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q3U4G0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q3U4G0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q3U4G0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3U4G0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q3U4G0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q3U4G0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3U4G0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Q3U4G0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q3U4G0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3U4G0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q3U4G0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q3U4G0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q3U4G0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3U4G0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Q3U4G0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q3U4G0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Q3U4G0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Q3U4G0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q3U4G0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Q3U4G0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Q3U4G0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3U4G0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Q3U4G0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3U4G0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Q3U4G0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Q3U4G0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3U4G0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Q3U4G0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Q3U4G0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3U4G0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Q3U4G0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q3U4G0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q3U4G0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Q3U4G0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q3U4G0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Q3U4G0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Q3U4G0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3U4G0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q3U4G0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3U4G0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3U4G0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q3U4G0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3U4G0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3U4G0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Q3U4G0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3U4G0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3U4G0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Q3U4G0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3U4G0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3U4G0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q3U4G0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3U4G0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q3U4G0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q3U4G0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3U4G0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3U4G0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q3U4G0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q3U4G0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q3U4G0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3U4G0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3U4G0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3U4G0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q3U4G0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3U4G0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q3U4G0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q3U4G0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q3U4G0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q3U4G0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q3U4G0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q3U4G0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q3U4G0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q3U4G0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3U4G0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3U4G0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q3U4G0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3U4G0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3U4G0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q3U4G0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3U4G0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3U4G0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3U4G0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3U4G0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3U4G0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q3U4G0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms