Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gse1Q3U3C9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Gse1Q3U3C9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gse1Q3U3C9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gse1Q3U3C9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Gse1Q3U3C9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gse1Q3U3C9 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gse1Q3U3C9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gse1Q3U3C9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Gse1Q3U3C9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gse1Q3U3C9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gse1Q3U3C9 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gse1Q3U3C9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gse1Q3U3C9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Gse1Q3U3C9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gse1Q3U3C9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gse1Q3U3C9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gse1Q3U3C9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gse1Q3U3C9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gse1Q3U3C9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gse1Q3U3C9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gse1Q3U3C9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gse1Q3U3C9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gse1Q3U3C9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gse1Q3U3C9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gse1Q3U3C9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gse1Q3U3C9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gse1Q3U3C9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Gse1Q3U3C9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gse1Q3U3C9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Gse1Q3U3C9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Gse1Q3U3C9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gse1Q3U3C9 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Gse1Q3U3C9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Gse1Q3U3C9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gse1Q3U3C9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Gse1Q3U3C9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Gse1Q3U3C9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Gse1Q3U3C9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Gse1Q3U3C9 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Gse1Q3U3C9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Gse1Q3U3C9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Gse1Q3U3C9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gse1Q3U3C9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gse1Q3U3C9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Gse1Q3U3C9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Gse1Q3U3C9 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Gse1Q3U3C9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Gse1Q3U3C9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gse1Q3U3C9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Gse1Q3U3C9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Gse1Q3U3C9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gse1Q3U3C9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gse1Q3U3C9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gse1Q3U3C9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Gse1Q3U3C9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Gse1Q3U3C9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Gse1Q3U3C9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Gse1Q3U3C9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gse1Q3U3C9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Gse1Q3U3C9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gse1Q3U3C9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gse1Q3U3C9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Gse1Q3U3C9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gse1Q3U3C9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Gse1Q3U3C9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
Gse1Q3U3C9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gse1Q3U3C9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gse1Q3U3C9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Gse1Q3U3C9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gse1Q3U3C9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Gse1Q3U3C9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Gse1Q3U3C9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Gse1Q3U3C9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Gse1Q3U3C9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Gse1Q3U3C9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gse1Q3U3C9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gse1Q3U3C9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Gse1Q3U3C9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gse1Q3U3C9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Gse1Q3U3C9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gse1Q3U3C9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Gse1Q3U3C9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gse1Q3U3C9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Gse1Q3U3C9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Gse1Q3U3C9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Gse1Q3U3C9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gse1Q3U3C9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Gse1Q3U3C9 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Gse1Q3U3C9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gse1Q3U3C9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Gse1Q3U3C9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gse1Q3U3C9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Gse1Q3U3C9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Gse1Q3U3C9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Gse1Q3U3C9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gse1Q3U3C9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gse1Q3U3C9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gse1Q3U3C9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Gse1Q3U3C9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms