Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rasip1Q3U0S6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rasip1Q3U0S6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rasip1Q3U0S6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rasip1Q3U0S6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rasip1Q3U0S6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Rasip1Q3U0S6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rasip1Q3U0S6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rasip1Q3U0S6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rasip1Q3U0S6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rasip1Q3U0S6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rasip1Q3U0S6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rasip1Q3U0S6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rasip1Q3U0S6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rasip1Q3U0S6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rasip1Q3U0S6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rasip1Q3U0S6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rasip1Q3U0S6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rasip1Q3U0S6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rasip1Q3U0S6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rasip1Q3U0S6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rasip1Q3U0S6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Rasip1Q3U0S6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rasip1Q3U0S6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Rasip1Q3U0S6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Rasip1Q3U0S6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Rasip1Q3U0S6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rasip1Q3U0S6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rasip1Q3U0S6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rasip1Q3U0S6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Rasip1Q3U0S6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rasip1Q3U0S6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Rasip1Q3U0S6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Rasip1Q3U0S6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Rasip1Q3U0S6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Rasip1Q3U0S6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Rasip1Q3U0S6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rasip1Q3U0S6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Rasip1Q3U0S6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Rasip1Q3U0S6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Rasip1Q3U0S6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Rasip1Q3U0S6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Rasip1Q3U0S6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rasip1Q3U0S6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rasip1Q3U0S6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Rasip1Q3U0S6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Rasip1Q3U0S6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Rasip1Q3U0S6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rasip1Q3U0S6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Rasip1Q3U0S6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Rasip1Q3U0S6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Rasip1Q3U0S6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Rasip1Q3U0S6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rasip1Q3U0S6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Rasip1Q3U0S6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Rasip1Q3U0S6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rasip1Q3U0S6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Rasip1Q3U0S6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Rasip1Q3U0S6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Rasip1Q3U0S6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Rasip1Q3U0S6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rasip1Q3U0S6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Rasip1Q3U0S6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rasip1Q3U0S6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rasip1Q3U0S6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Rasip1Q3U0S6 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Rasip1Q3U0S6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rasip1Q3U0S6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rasip1Q3U0S6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rasip1Q3U0S6 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Rasip1Q3U0S6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rasip1Q3U0S6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Rasip1Q3U0S6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Rasip1Q3U0S6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rasip1Q3U0S6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rasip1Q3U0S6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Rasip1Q3U0S6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rasip1Q3U0S6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rasip1Q3U0S6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Rasip1Q3U0S6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rasip1Q3U0S6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rasip1Q3U0S6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Rasip1Q3U0S6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Rasip1Q3U0S6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Rasip1Q3U0S6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rasip1Q3U0S6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rasip1Q3U0S6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Rasip1Q3U0S6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Rasip1Q3U0S6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rasip1Q3U0S6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rasip1Q3U0S6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Rasip1Q3U0S6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rasip1Q3U0S6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rasip1Q3U0S6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rasip1Q3U0S6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rasip1Q3U0S6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Rasip1Q3U0S6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rasip1Q3U0S6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rasip1Q3U0S6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Rasip1Q3U0S6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms