Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cib3Q0P523 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cib3Q0P523 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cib3Q0P523 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cib3Q0P523 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Cib3Q0P523 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cib3Q0P523 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cib3Q0P523 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cib3Q0P523 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cib3Q0P523 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cib3Q0P523 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cib3Q0P523 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cib3Q0P523 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cib3Q0P523 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cib3Q0P523 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cib3Q0P523 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cib3Q0P523 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib3Q0P523 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib3Q0P523 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cib3Q0P523 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib3Q0P523 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib3Q0P523 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib3Q0P523 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cib3Q0P523 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cib3Q0P523 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cib3Q0P523 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cib3Q0P523 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cib3Q0P523 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cib3Q0P523 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms