Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnn1Q08091 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cnn1Q08091 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cnn1Q08091 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnn1Q08091 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnn1Q08091 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnn1Q08091 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cnn1Q08091 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cnn1Q08091 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Cnn1Q08091 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnn1Q08091 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Cnn1Q08091 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cnn1Q08091 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cnn1Q08091 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnn1Q08091 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cnn1Q08091 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnn1Q08091 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnn1Q08091 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnn1Q08091 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cnn1Q08091 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnn1Q08091 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnn1Q08091 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnn1Q08091 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cnn1Q08091 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cnn1Q08091 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cnn1Q08091 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cnn1Q08091 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cnn1Q08091 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cnn1Q08091 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn1Q08091 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn1Q08091 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn1Q08091 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn1Q08091 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cnn1Q08091 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnn1Q08091 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cnn1Q08091 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnn1Q08091 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnn1Q08091 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cnn1Q08091 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnn1Q08091 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnn1Q08091 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cnn1Q08091 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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