Protein–RNA interactions for Protein: Q06507

Atf4, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-4, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf4Q06507 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Atf4Q06507 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf4Q06507 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atf4Q06507 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atf4Q06507 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atf4Q06507 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atf4Q06507 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf4Q06507 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atf4Q06507 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atf4Q06507 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atf4Q06507 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atf4Q06507 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atf4Q06507 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atf4Q06507 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atf4Q06507 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf4Q06507 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atf4Q06507 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf4Q06507 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf4Q06507 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atf4Q06507 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atf4Q06507 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Atf4Q06507 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf4Q06507 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf4Q06507 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf4Q06507 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf4Q06507 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Atf4Q06507 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf4Q06507 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Atf4Q06507 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf4Q06507 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Atf4Q06507 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf4Q06507 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Atf4Q06507 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf4Q06507 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Atf4Q06507 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf4Q06507 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf4Q06507 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Atf4Q06507 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Atf4Q06507 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Atf4Q06507 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf4Q06507 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf4Q06507 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf4Q06507 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf4Q06507 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf4Q06507 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Atf4Q06507 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf4Q06507 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Atf4Q06507 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Atf4Q06507 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf4Q06507 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Atf4Q06507 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf4Q06507 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Atf4Q06507 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf4Q06507 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf4Q06507 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Atf4Q06507 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf4Q06507 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Atf4Q06507 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Atf4Q06507 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf4Q06507 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Atf4Q06507 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Atf4Q06507 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf4Q06507 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atf4Q06507 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf4Q06507 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf4Q06507 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf4Q06507 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atf4Q06507 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atf4Q06507 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf4Q06507 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atf4Q06507 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf4Q06507 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf4Q06507 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf4Q06507 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atf4Q06507 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atf4Q06507 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atf4Q06507 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf4Q06507 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atf4Q06507 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf4Q06507 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atf4Q06507 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf4Q06507 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atf4Q06507 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atf4Q06507 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atf4Q06507 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf4Q06507 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf4Q06507 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atf4Q06507 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atf4Q06507 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Atf4Q06507 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf4Q06507 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf4Q06507 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atf4Q06507 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atf4Q06507 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf4Q06507 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf4Q06507 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf4Q06507 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atf4Q06507 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf4Q06507 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atf4Q06507 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms