Protein–RNA interactions for Protein: Q04447

Ckb, Creatine kinase B-type, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CkbQ04447 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CkbQ04447 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CkbQ04447 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CkbQ04447 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CkbQ04447 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CkbQ04447 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CkbQ04447 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CkbQ04447 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CkbQ04447 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CkbQ04447 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CkbQ04447 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CkbQ04447 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CkbQ04447 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CkbQ04447 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CkbQ04447 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CkbQ04447 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CkbQ04447 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CkbQ04447 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CkbQ04447 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CkbQ04447 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CkbQ04447 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CkbQ04447 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CkbQ04447 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CkbQ04447 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CkbQ04447 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CkbQ04447 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CkbQ04447 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CkbQ04447 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CkbQ04447 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CkbQ04447 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CkbQ04447 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CkbQ04447 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CkbQ04447 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CkbQ04447 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CkbQ04447 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CkbQ04447 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CkbQ04447 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CkbQ04447 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CkbQ04447 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CkbQ04447 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CkbQ04447 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CkbQ04447 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CkbQ04447 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CkbQ04447 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CkbQ04447 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CkbQ04447 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CkbQ04447 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CkbQ04447 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
CkbQ04447 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CkbQ04447 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CkbQ04447 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CkbQ04447 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CkbQ04447 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CkbQ04447 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CkbQ04447 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CkbQ04447 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CkbQ04447 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CkbQ04447 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
CkbQ04447 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CkbQ04447 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CkbQ04447 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CkbQ04447 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CkbQ04447 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CkbQ04447 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CkbQ04447 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CkbQ04447 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CkbQ04447 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CkbQ04447 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CkbQ04447 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CkbQ04447 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CkbQ04447 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CkbQ04447 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CkbQ04447 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CkbQ04447 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CkbQ04447 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CkbQ04447 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CkbQ04447 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CkbQ04447 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CkbQ04447 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CkbQ04447 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CkbQ04447 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CkbQ04447 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CkbQ04447 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CkbQ04447 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CkbQ04447 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CkbQ04447 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CkbQ04447 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CkbQ04447 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CkbQ04447 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CkbQ04447 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CkbQ04447 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CkbQ04447 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CkbQ04447 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CkbQ04447 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CkbQ04447 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CkbQ04447 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CkbQ04447 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CkbQ04447 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CkbQ04447 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CkbQ04447 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.4 ms