Protein–RNA interactions for Protein: Q00417

Tcf7, Transcription factor 7, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcf7Q00417 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf7Q00417 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tcf7Q00417 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf7Q00417 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf7Q00417 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tcf7Q00417 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf7Q00417 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tcf7Q00417 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf7Q00417 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tcf7Q00417 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tcf7Q00417 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf7Q00417 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf7Q00417 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tcf7Q00417 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf7Q00417 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tcf7Q00417 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf7Q00417 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf7Q00417 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf7Q00417 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf7Q00417 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tcf7Q00417 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf7Q00417 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tcf7Q00417 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tcf7Q00417 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf7Q00417 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf7Q00417 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tcf7Q00417 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf7Q00417 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Tcf7Q00417 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf7Q00417 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tcf7Q00417 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tcf7Q00417 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf7Q00417 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tcf7Q00417 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf7Q00417 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf7Q00417 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Tcf7Q00417 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tcf7Q00417 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf7Q00417 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf7Q00417 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf7Q00417 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tcf7Q00417 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tcf7Q00417 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcf7Q00417 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tcf7Q00417 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf7Q00417 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf7Q00417 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tcf7Q00417 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcf7Q00417 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcf7Q00417 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcf7Q00417 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf7Q00417 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf7Q00417 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcf7Q00417 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcf7Q00417 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcf7Q00417 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcf7Q00417 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcf7Q00417 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tcf7Q00417 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tcf7Q00417 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tcf7Q00417 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms