Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.15■■■■□ 3.7
AlkP97793 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC38.15■■■■□ 3.7
AlkP97793 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
AlkP97793 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
AlkP97793 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
AlkP97793 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
AlkP97793 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
AlkP97793 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
AlkP97793 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
AlkP97793 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
AlkP97793 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
AlkP97793 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC38.01■■■■□ 3.67
AlkP97793 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC37.99■■■■□ 3.67
AlkP97793 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
AlkP97793 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC37.98■■■■□ 3.67
AlkP97793 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
AlkP97793 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
AlkP97793 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
AlkP97793 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
AlkP97793 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
AlkP97793 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
AlkP97793 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
AlkP97793 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
AlkP97793 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
AlkP97793 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.9■■■■□ 3.66
AlkP97793 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
AlkP97793 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
AlkP97793 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
AlkP97793 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
AlkP97793 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
AlkP97793 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
AlkP97793 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
AlkP97793 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
AlkP97793 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC37.81■■■■□ 3.64
AlkP97793 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
AlkP97793 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
AlkP97793 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
AlkP97793 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC37.77■■■■□ 3.64
AlkP97793 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
AlkP97793 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
AlkP97793 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
AlkP97793 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
AlkP97793 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
AlkP97793 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
AlkP97793 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
AlkP97793 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
AlkP97793 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
AlkP97793 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
AlkP97793 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
AlkP97793 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37.69■■■■□ 3.62
AlkP97793 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
AlkP97793 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
AlkP97793 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
AlkP97793 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
AlkP97793 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
AlkP97793 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
AlkP97793 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
AlkP97793 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC37.61■■■■□ 3.61
AlkP97793 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
AlkP97793 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
AlkP97793 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
AlkP97793 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
AlkP97793 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
AlkP97793 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
AlkP97793 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
AlkP97793 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
AlkP97793 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
AlkP97793 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
AlkP97793 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
AlkP97793 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
AlkP97793 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
AlkP97793 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
AlkP97793 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
AlkP97793 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
AlkP97793 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
AlkP97793 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
AlkP97793 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
AlkP97793 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
AlkP97793 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
AlkP97793 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
AlkP97793 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
AlkP97793 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
AlkP97793 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC37.38■■■■□ 3.57
AlkP97793 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
AlkP97793 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC37.37■■■■□ 3.57
AlkP97793 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
AlkP97793 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
AlkP97793 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
AlkP97793 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.32■■■■□ 3.56
AlkP97793 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
AlkP97793 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
AlkP97793 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
AlkP97793 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
AlkP97793 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
AlkP97793 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
AlkP97793 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
AlkP97793 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
AlkP97793 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
AlkP97793 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
AlkP97793 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms