Protein–RNA interactions for Protein: P97386

Lig3, DNA ligase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,015 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig3P97386 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lig3P97386 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lig3P97386 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lig3P97386 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Lig3P97386 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lig3P97386 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Lig3P97386 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Lig3P97386 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lig3P97386 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lig3P97386 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lig3P97386 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Lig3P97386 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lig3P97386 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lig3P97386 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lig3P97386 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lig3P97386 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lig3P97386 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lig3P97386 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lig3P97386 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lig3P97386 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lig3P97386 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lig3P97386 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Lig3P97386 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Lig3P97386 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lig3P97386 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lig3P97386 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lig3P97386 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lig3P97386 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lig3P97386 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Lig3P97386 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Lig3P97386 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lig3P97386 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lig3P97386 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Lig3P97386 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lig3P97386 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lig3P97386 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lig3P97386 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lig3P97386 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Lig3P97386 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lig3P97386 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Lig3P97386 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Lig3P97386 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Lig3P97386 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lig3P97386 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Lig3P97386 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Lig3P97386 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lig3P97386 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Lig3P97386 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lig3P97386 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Lig3P97386 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Lig3P97386 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Lig3P97386 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Lig3P97386 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Lig3P97386 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Lig3P97386 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Lig3P97386 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Lig3P97386 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Lig3P97386 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Lig3P97386 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lig3P97386 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Lig3P97386 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lig3P97386 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lig3P97386 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lig3P97386 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lig3P97386 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Lig3P97386 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lig3P97386 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Lig3P97386 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lig3P97386 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lig3P97386 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lig3P97386 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lig3P97386 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Lig3P97386 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lig3P97386 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lig3P97386 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lig3P97386 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lig3P97386 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lig3P97386 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lig3P97386 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lig3P97386 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lig3P97386 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lig3P97386 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lig3P97386 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lig3P97386 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lig3P97386 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lig3P97386 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lig3P97386 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lig3P97386 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lig3P97386 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lig3P97386 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lig3P97386 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lig3P97386 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lig3P97386 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lig3P97386 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lig3P97386 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lig3P97386 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lig3P97386 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lig3P97386 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lig3P97386 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Lig3P97386 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms