Protein–RNA interactions for Protein: P84078

Arf1, ADP-ribosylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf1P84078 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arf1P84078 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arf1P84078 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Arf1P84078 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Arf1P84078 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arf1P84078 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Arf1P84078 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Arf1P84078 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arf1P84078 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Arf1P84078 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arf1P84078 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Arf1P84078 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Arf1P84078 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Arf1P84078 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Arf1P84078 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arf1P84078 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Arf1P84078 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arf1P84078 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Arf1P84078 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arf1P84078 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arf1P84078 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Arf1P84078 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arf1P84078 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arf1P84078 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Arf1P84078 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arf1P84078 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arf1P84078 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Arf1P84078 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arf1P84078 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Arf1P84078 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arf1P84078 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arf1P84078 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arf1P84078 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Arf1P84078 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arf1P84078 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Arf1P84078 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Arf1P84078 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Arf1P84078 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Arf1P84078 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Arf1P84078 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arf1P84078 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Arf1P84078 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arf1P84078 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Arf1P84078 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arf1P84078 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arf1P84078 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Arf1P84078 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Arf1P84078 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Arf1P84078 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arf1P84078 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Arf1P84078 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arf1P84078 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Arf1P84078 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Arf1P84078 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Arf1P84078 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arf1P84078 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Arf1P84078 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Arf1P84078 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arf1P84078 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Arf1P84078 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arf1P84078 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arf1P84078 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arf1P84078 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arf1P84078 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Arf1P84078 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arf1P84078 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Arf1P84078 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Arf1P84078 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Arf1P84078 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Arf1P84078 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arf1P84078 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arf1P84078 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Arf1P84078 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arf1P84078 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Arf1P84078 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Arf1P84078 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Arf1P84078 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arf1P84078 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Arf1P84078 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Arf1P84078 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Arf1P84078 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arf1P84078 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arf1P84078 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arf1P84078 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Arf1P84078 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Arf1P84078 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arf1P84078 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arf1P84078 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arf1P84078 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arf1P84078 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arf1P84078 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms