Protein–RNA interactions for Protein: P70436

Dlx4, Homeobox protein DLX-4, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dlx4P70436 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dlx4P70436 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Dlx4P70436 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Dlx4P70436 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Dlx4P70436 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dlx4P70436 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Dlx4P70436 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dlx4P70436 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Dlx4P70436 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dlx4P70436 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dlx4P70436 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dlx4P70436 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dlx4P70436 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Dlx4P70436 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Dlx4P70436 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dlx4P70436 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Dlx4P70436 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Dlx4P70436 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Dlx4P70436 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Dlx4P70436 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dlx4P70436 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dlx4P70436 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Dlx4P70436 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Dlx4P70436 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dlx4P70436 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dlx4P70436 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Dlx4P70436 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dlx4P70436 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Dlx4P70436 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Dlx4P70436 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dlx4P70436 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Dlx4P70436 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Dlx4P70436 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dlx4P70436 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dlx4P70436 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dlx4P70436 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dlx4P70436 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dlx4P70436 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dlx4P70436 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dlx4P70436 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dlx4P70436 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dlx4P70436 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dlx4P70436 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dlx4P70436 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dlx4P70436 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Dlx4P70436 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dlx4P70436 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dlx4P70436 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dlx4P70436 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dlx4P70436 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dlx4P70436 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dlx4P70436 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dlx4P70436 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dlx4P70436 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dlx4P70436 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dlx4P70436 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dlx4P70436 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dlx4P70436 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dlx4P70436 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dlx4P70436 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dlx4P70436 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dlx4P70436 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Dlx4P70436 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Dlx4P70436 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dlx4P70436 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dlx4P70436 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dlx4P70436 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dlx4P70436 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dlx4P70436 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dlx4P70436 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Dlx4P70436 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dlx4P70436 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dlx4P70436 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dlx4P70436 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Dlx4P70436 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dlx4P70436 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dlx4P70436 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dlx4P70436 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dlx4P70436 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dlx4P70436 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dlx4P70436 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dlx4P70436 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Dlx4P70436 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Dlx4P70436 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.6 ms