Protein–RNA interactions for Protein: P62317

Snrpd2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd2P62317 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Snrpd2P62317 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpd2P62317 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Snrpd2P62317 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrpd2P62317 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrpd2P62317 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Snrpd2P62317 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpd2P62317 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpd2P62317 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Snrpd2P62317 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Snrpd2P62317 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrpd2P62317 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Snrpd2P62317 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpd2P62317 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Snrpd2P62317 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpd2P62317 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Snrpd2P62317 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpd2P62317 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Snrpd2P62317 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpd2P62317 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpd2P62317 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpd2P62317 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Snrpd2P62317 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpd2P62317 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Snrpd2P62317 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Snrpd2P62317 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Snrpd2P62317 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpd2P62317 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Snrpd2P62317 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Snrpd2P62317 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpd2P62317 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Snrpd2P62317 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpd2P62317 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Snrpd2P62317 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpd2P62317 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpd2P62317 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Snrpd2P62317 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpd2P62317 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Snrpd2P62317 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpd2P62317 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpd2P62317 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Snrpd2P62317 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpd2P62317 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpd2P62317 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Snrpd2P62317 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Snrpd2P62317 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpd2P62317 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpd2P62317 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpd2P62317 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Snrpd2P62317 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Snrpd2P62317 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpd2P62317 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snrpd2P62317 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpd2P62317 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpd2P62317 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Snrpd2P62317 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpd2P62317 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpd2P62317 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpd2P62317 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snrpd2P62317 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snrpd2P62317 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpd2P62317 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpd2P62317 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snrpd2P62317 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpd2P62317 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snrpd2P62317 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snrpd2P62317 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snrpd2P62317 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms