Protein–RNA interactions for Protein: P61407

Tdrd6, Tudor domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd6P61407 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tdrd6P61407 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tdrd6P61407 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tdrd6P61407 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tdrd6P61407 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tdrd6P61407 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd6P61407 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd6P61407 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Tdrd6P61407 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tdrd6P61407 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tdrd6P61407 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tdrd6P61407 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tdrd6P61407 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tdrd6P61407 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tdrd6P61407 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tdrd6P61407 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tdrd6P61407 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms