Protein–RNA interactions for Protein: P59997

Kdm2a, Lysine-specific demethylase 2A, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm2aP59997 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Kdm2aP59997 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm2aP59997 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm2aP59997 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Kdm2aP59997 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Kdm2aP59997 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Kdm2aP59997 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
Kdm2aP59997 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Kdm2aP59997 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Kdm2aP59997 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm2aP59997 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm2aP59997 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Kdm2aP59997 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Kdm2aP59997 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Kdm2aP59997 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Kdm2aP59997 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Kdm2aP59997 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Kdm2aP59997 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Kdm2aP59997 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Kdm2aP59997 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Kdm2aP59997 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Kdm2aP59997 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Kdm2aP59997 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Kdm2aP59997 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kdm2aP59997 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Kdm2aP59997 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Kdm2aP59997 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Kdm2aP59997 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Kdm2aP59997 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Kdm2aP59997 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Kdm2aP59997 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Kdm2aP59997 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Kdm2aP59997 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Kdm2aP59997 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Kdm2aP59997 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Kdm2aP59997 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC36.04■■■■□ 3.36
Kdm2aP59997 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Kdm2aP59997 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Kdm2aP59997 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36.01■■■■□ 3.35
Kdm2aP59997 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
Kdm2aP59997 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
Kdm2aP59997 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Kdm2aP59997 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Kdm2aP59997 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Kdm2aP59997 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.96■■■■□ 3.35
Kdm2aP59997 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Kdm2aP59997 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Kdm2aP59997 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Kdm2aP59997 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Kdm2aP59997 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Kdm2aP59997 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Kdm2aP59997 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Kdm2aP59997 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC35.87■■■■□ 3.33
Kdm2aP59997 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Kdm2aP59997 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Kdm2aP59997 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Kdm2aP59997 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Kdm2aP59997 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Kdm2aP59997 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
Kdm2aP59997 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm2aP59997 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm2aP59997 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Kdm2aP59997 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.73■■■■□ 3.31
Kdm2aP59997 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Kdm2aP59997 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Kdm2aP59997 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Kdm2aP59997 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Kdm2aP59997 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm2aP59997 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm2aP59997 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm2aP59997 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.67■■■■□ 3.3
Kdm2aP59997 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm2aP59997 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm2aP59997 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Kdm2aP59997 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Kdm2aP59997 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
Kdm2aP59997 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Kdm2aP59997 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Kdm2aP59997 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Kdm2aP59997 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
Kdm2aP59997 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Kdm2aP59997 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Kdm2aP59997 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Kdm2aP59997 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Kdm2aP59997 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Kdm2aP59997 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Kdm2aP59997 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Kdm2aP59997 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Kdm2aP59997 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Kdm2aP59997 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Kdm2aP59997 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Kdm2aP59997 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Kdm2aP59997 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm2aP59997 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Kdm2aP59997 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Kdm2aP59997 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Kdm2aP59997 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Kdm2aP59997 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Kdm2aP59997 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Kdm2aP59997 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.6 ms