Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Nphp4P59240 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Nphp4P59240 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Nphp4P59240 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
Nphp4P59240 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
Nphp4P59240 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
Nphp4P59240 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Nphp4P59240 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Nphp4P59240 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
Nphp4P59240 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
Nphp4P59240 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Nphp4P59240 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
Nphp4P59240 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
Nphp4P59240 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Nphp4P59240 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
Nphp4P59240 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
Nphp4P59240 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
Nphp4P59240 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Nphp4P59240 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Nphp4P59240 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
Nphp4P59240 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.68■■■■□ 3.3
Nphp4P59240 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Nphp4P59240 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Nphp4P59240 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Nphp4P59240 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
Nphp4P59240 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Nphp4P59240 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Nphp4P59240 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Nphp4P59240 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
Nphp4P59240 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Nphp4P59240 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
Nphp4P59240 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
Nphp4P59240 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
Nphp4P59240 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Nphp4P59240 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
Nphp4P59240 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Nphp4P59240 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Nphp4P59240 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Nphp4P59240 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Nphp4P59240 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Nphp4P59240 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Nphp4P59240 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Nphp4P59240 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Nphp4P59240 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Nphp4P59240 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Nphp4P59240 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Nphp4P59240 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Nphp4P59240 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Nphp4P59240 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Nphp4P59240 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
Nphp4P59240 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.44■■■■□ 3.26
Nphp4P59240 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Nphp4P59240 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Nphp4P59240 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Nphp4P59240 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Nphp4P59240 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Nphp4P59240 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Nphp4P59240 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Nphp4P59240 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Nphp4P59240 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
Nphp4P59240 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Nphp4P59240 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Nphp4P59240 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Nphp4P59240 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Nphp4P59240 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Nphp4P59240 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Nphp4P59240 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.33■■■■□ 3.25
Nphp4P59240 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Nphp4P59240 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Nphp4P59240 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Nphp4P59240 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Nphp4P59240 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Nphp4P59240 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Nphp4P59240 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Nphp4P59240 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Nphp4P59240 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Nphp4P59240 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Nphp4P59240 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Nphp4P59240 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Nphp4P59240 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Nphp4P59240 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Nphp4P59240 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Nphp4P59240 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Nphp4P59240 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Nphp4P59240 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
Nphp4P59240 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Nphp4P59240 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Nphp4P59240 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Nphp4P59240 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Nphp4P59240 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Nphp4P59240 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Nphp4P59240 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Nphp4P59240 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Nphp4P59240 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Nphp4P59240 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Nphp4P59240 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Nphp4P59240 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Nphp4P59240 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Nphp4P59240 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Nphp4P59240 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms