Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Strn4P58404 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Strn4P58404 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Strn4P58404 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Strn4P58404 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Strn4P58404 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Strn4P58404 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Strn4P58404 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Strn4P58404 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Strn4P58404 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Strn4P58404 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Strn4P58404 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Strn4P58404 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Strn4P58404 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Strn4P58404 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Strn4P58404 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Strn4P58404 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Strn4P58404 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Strn4P58404 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Strn4P58404 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Strn4P58404 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Strn4P58404 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Strn4P58404 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Strn4P58404 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Strn4P58404 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Strn4P58404 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Strn4P58404 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Strn4P58404 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
Strn4P58404 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Strn4P58404 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Strn4P58404 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Strn4P58404 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Strn4P58404 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Strn4P58404 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Strn4P58404 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Strn4P58404 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Strn4P58404 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Strn4P58404 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Strn4P58404 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
Strn4P58404 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Strn4P58404 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Strn4P58404 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Strn4P58404 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Strn4P58404 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Strn4P58404 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Strn4P58404 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Strn4P58404 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Strn4P58404 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Strn4P58404 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
Strn4P58404 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
Strn4P58404 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Strn4P58404 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Strn4P58404 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Strn4P58404 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Strn4P58404 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Strn4P58404 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Strn4P58404 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Strn4P58404 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Strn4P58404 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Strn4P58404 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Strn4P58404 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Strn4P58404 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Strn4P58404 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Strn4P58404 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Strn4P58404 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Strn4P58404 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Strn4P58404 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Strn4P58404 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Strn4P58404 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Strn4P58404 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Strn4P58404 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Strn4P58404 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Strn4P58404 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
Strn4P58404 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Strn4P58404 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Strn4P58404 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Strn4P58404 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
Strn4P58404 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Strn4P58404 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Strn4P58404 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Strn4P58404 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Strn4P58404 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC31.86■■■□□ 2.69
Strn4P58404 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
Strn4P58404 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Strn4P58404 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Strn4P58404 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Strn4P58404 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Strn4P58404 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Strn4P58404 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Strn4P58404 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Strn4P58404 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Strn4P58404 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Strn4P58404 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Strn4P58404 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Strn4P58404 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Strn4P58404 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Strn4P58404 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Strn4P58404 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.68
Strn4P58404 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC31.76■■■□□ 2.67
Strn4P58404 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms