Protein–RNA interactions for Protein: P56394

Cox17, Cytochrome c oxidase copper chaperone, mousemouse

Predictions only

Length 63 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox17P56394 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cox17P56394 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cox17P56394 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Cox17P56394 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox17P56394 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cox17P56394 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox17P56394 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cox17P56394 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cox17P56394 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox17P56394 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox17P56394 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox17P56394 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cox17P56394 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox17P56394 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cox17P56394 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox17P56394 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cox17P56394 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cox17P56394 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cox17P56394 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cox17P56394 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox17P56394 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox17P56394 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox17P56394 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cox17P56394 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox17P56394 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cox17P56394 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox17P56394 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox17P56394 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox17P56394 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cox17P56394 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cox17P56394 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox17P56394 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cox17P56394 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cox17P56394 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms