Protein–RNA interactions for Protein: P50708

Defa10, Alpha-defensin 10, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa10P50708 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa10P50708 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Defa10P50708 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa10P50708 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa10P50708 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Defa10P50708 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa10P50708 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa10P50708 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa10P50708 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa10P50708 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa10P50708 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa10P50708 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa10P50708 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa10P50708 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa10P50708 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa10P50708 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms