Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tulp2P46686 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tulp2P46686 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tulp2P46686 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tulp2P46686 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tulp2P46686 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Tulp2P46686 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tulp2P46686 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tulp2P46686 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tulp2P46686 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tulp2P46686 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tulp2P46686 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Tulp2P46686 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tulp2P46686 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tulp2P46686 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tulp2P46686 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tulp2P46686 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tulp2P46686 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tulp2P46686 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Tulp2P46686 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Tulp2P46686 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tulp2P46686 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tulp2P46686 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tulp2P46686 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tulp2P46686 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tulp2P46686 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tulp2P46686 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tulp2P46686 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tulp2P46686 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tulp2P46686 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tulp2P46686 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tulp2P46686 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tulp2P46686 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tulp2P46686 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tulp2P46686 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tulp2P46686 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tulp2P46686 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tulp2P46686 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tulp2P46686 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tulp2P46686 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tulp2P46686 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tulp2P46686 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tulp2P46686 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Tulp2P46686 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tulp2P46686 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tulp2P46686 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tulp2P46686 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tulp2P46686 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tulp2P46686 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tulp2P46686 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tulp2P46686 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tulp2P46686 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tulp2P46686 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tulp2P46686 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Tulp2P46686 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Tulp2P46686 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tulp2P46686 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tulp2P46686 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tulp2P46686 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Tulp2P46686 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tulp2P46686 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Tulp2P46686 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Tulp2P46686 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tulp2P46686 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tulp2P46686 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tulp2P46686 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Tulp2P46686 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Tulp2P46686 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tulp2P46686 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tulp2P46686 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tulp2P46686 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Tulp2P46686 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Tulp2P46686 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Tulp2P46686 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tulp2P46686 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Tulp2P46686 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tulp2P46686 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tulp2P46686 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Tulp2P46686 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Tulp2P46686 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tulp2P46686 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tulp2P46686 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Tulp2P46686 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Tulp2P46686 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Tulp2P46686 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Tulp2P46686 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Tulp2P46686 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tulp2P46686 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tulp2P46686 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tulp2P46686 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tulp2P46686 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tulp2P46686 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Tulp2P46686 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tulp2P46686 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tulp2P46686 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Tulp2P46686 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tulp2P46686 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tulp2P46686 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Tulp2P46686 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Tulp2P46686 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms