Protein–RNA interactions for Protein: P35918

Kdr, Vascular endothelial growth factor receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KdrP35918 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
KdrP35918 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
KdrP35918 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
KdrP35918 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KdrP35918 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
KdrP35918 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
KdrP35918 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KdrP35918 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
KdrP35918 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
KdrP35918 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
KdrP35918 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
KdrP35918 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
KdrP35918 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
KdrP35918 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC35.7■■■■□ 3.3
KdrP35918 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
KdrP35918 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
KdrP35918 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
KdrP35918 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
KdrP35918 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
KdrP35918 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
KdrP35918 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
KdrP35918 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
KdrP35918 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.29
KdrP35918 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
KdrP35918 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KdrP35918 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
KdrP35918 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
KdrP35918 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
KdrP35918 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
KdrP35918 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
KdrP35918 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
KdrP35918 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
KdrP35918 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
KdrP35918 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
KdrP35918 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
KdrP35918 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KdrP35918 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
KdrP35918 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35.41■■■■□ 3.26
KdrP35918 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
KdrP35918 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.26
KdrP35918 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
KdrP35918 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
KdrP35918 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
KdrP35918 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
KdrP35918 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
KdrP35918 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
KdrP35918 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
KdrP35918 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.33■■■■□ 3.25
KdrP35918 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
KdrP35918 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
KdrP35918 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
KdrP35918 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
KdrP35918 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
KdrP35918 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.27■■■■□ 3.24
KdrP35918 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
KdrP35918 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC35.24■■■■□ 3.23
KdrP35918 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
KdrP35918 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
KdrP35918 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
KdrP35918 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KdrP35918 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
KdrP35918 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KdrP35918 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
KdrP35918 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
KdrP35918 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
KdrP35918 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KdrP35918 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
KdrP35918 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.13■■■■□ 3.21
KdrP35918 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
KdrP35918 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
KdrP35918 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
KdrP35918 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
KdrP35918 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
KdrP35918 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
KdrP35918 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
KdrP35918 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
KdrP35918 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
KdrP35918 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
KdrP35918 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
KdrP35918 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
KdrP35918 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KdrP35918 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
KdrP35918 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
KdrP35918 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
KdrP35918 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
KdrP35918 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
KdrP35918 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
KdrP35918 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
KdrP35918 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KdrP35918 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KdrP35918 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
KdrP35918 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
KdrP35918 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KdrP35918 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KdrP35918 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
KdrP35918 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
KdrP35918 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
KdrP35918 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
KdrP35918 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
KdrP35918 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms