Protein–RNA interactions for Protein: P35846

Folr1, Folate receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Folr1P35846 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Folr1P35846 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Folr1P35846 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Folr1P35846 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Folr1P35846 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Folr1P35846 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Folr1P35846 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Folr1P35846 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Folr1P35846 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Folr1P35846 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Folr1P35846 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Folr1P35846 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Folr1P35846 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Folr1P35846 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Folr1P35846 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Folr1P35846 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Folr1P35846 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Folr1P35846 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Folr1P35846 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Folr1P35846 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Folr1P35846 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Folr1P35846 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Folr1P35846 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Folr1P35846 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Folr1P35846 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Folr1P35846 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Folr1P35846 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Folr1P35846 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Folr1P35846 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Folr1P35846 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Folr1P35846 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Folr1P35846 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Folr1P35846 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Folr1P35846 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Folr1P35846 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Folr1P35846 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Folr1P35846 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Folr1P35846 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Folr1P35846 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Folr1P35846 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Folr1P35846 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Folr1P35846 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Folr1P35846 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Folr1P35846 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Folr1P35846 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Folr1P35846 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Folr1P35846 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Folr1P35846 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Folr1P35846 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Folr1P35846 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Folr1P35846 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Folr1P35846 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Folr1P35846 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Folr1P35846 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Folr1P35846 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Folr1P35846 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Folr1P35846 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Folr1P35846 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Folr1P35846 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Folr1P35846 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Folr1P35846 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Folr1P35846 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Folr1P35846 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Folr1P35846 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Folr1P35846 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Folr1P35846 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Folr1P35846 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Folr1P35846 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Folr1P35846 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Folr1P35846 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Folr1P35846 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Folr1P35846 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Folr1P35846 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Folr1P35846 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Folr1P35846 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Folr1P35846 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Folr1P35846 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Folr1P35846 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Folr1P35846 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Folr1P35846 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Folr1P35846 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Folr1P35846 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Folr1P35846 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Folr1P35846 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Folr1P35846 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Folr1P35846 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Folr1P35846 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Folr1P35846 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Folr1P35846 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Folr1P35846 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Folr1P35846 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Folr1P35846 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Folr1P35846 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Folr1P35846 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Folr1P35846 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Folr1P35846 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Folr1P35846 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Folr1P35846 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Folr1P35846 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Folr1P35846 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms