Protein–RNA interactions for Protein: P32848

Pvalb, Parvalbumin alpha, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PvalbP32848 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PvalbP32848 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PvalbP32848 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PvalbP32848 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PvalbP32848 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PvalbP32848 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PvalbP32848 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PvalbP32848 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PvalbP32848 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PvalbP32848 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PvalbP32848 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PvalbP32848 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PvalbP32848 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PvalbP32848 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PvalbP32848 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PvalbP32848 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PvalbP32848 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PvalbP32848 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PvalbP32848 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PvalbP32848 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PvalbP32848 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PvalbP32848 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PvalbP32848 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PvalbP32848 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PvalbP32848 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PvalbP32848 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PvalbP32848 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PvalbP32848 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PvalbP32848 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PvalbP32848 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PvalbP32848 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PvalbP32848 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PvalbP32848 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PvalbP32848 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PvalbP32848 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PvalbP32848 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PvalbP32848 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PvalbP32848 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PvalbP32848 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PvalbP32848 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PvalbP32848 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PvalbP32848 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PvalbP32848 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PvalbP32848 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PvalbP32848 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PvalbP32848 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PvalbP32848 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PvalbP32848 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PvalbP32848 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PvalbP32848 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PvalbP32848 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PvalbP32848 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PvalbP32848 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PvalbP32848 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PvalbP32848 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PvalbP32848 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PvalbP32848 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PvalbP32848 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PvalbP32848 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PvalbP32848 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PvalbP32848 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PvalbP32848 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PvalbP32848 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PvalbP32848 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PvalbP32848 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PvalbP32848 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PvalbP32848 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PvalbP32848 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms