Protein–RNA interactions for Protein: P30999

Ctnnd1, Catenin delta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd1P30999 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ctnnd1P30999 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ctnnd1P30999 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ctnnd1P30999 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ctnnd1P30999 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ctnnd1P30999 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ctnnd1P30999 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ctnnd1P30999 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctnnd1P30999 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ctnnd1P30999 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ctnnd1P30999 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ctnnd1P30999 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ctnnd1P30999 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ctnnd1P30999 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctnnd1P30999 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctnnd1P30999 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ctnnd1P30999 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctnnd1P30999 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctnnd1P30999 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctnnd1P30999 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctnnd1P30999 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctnnd1P30999 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ctnnd1P30999 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ctnnd1P30999 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ctnnd1P30999 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ctnnd1P30999 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ctnnd1P30999 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ctnnd1P30999 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctnnd1P30999 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ctnnd1P30999 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ctnnd1P30999 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctnnd1P30999 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctnnd1P30999 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ctnnd1P30999 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctnnd1P30999 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctnnd1P30999 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ctnnd1P30999 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ctnnd1P30999 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ctnnd1P30999 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctnnd1P30999 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ctnnd1P30999 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctnnd1P30999 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctnnd1P30999 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ctnnd1P30999 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ctnnd1P30999 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctnnd1P30999 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ctnnd1P30999 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ctnnd1P30999 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctnnd1P30999 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ctnnd1P30999 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ctnnd1P30999 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ctnnd1P30999 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctnnd1P30999 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ctnnd1P30999 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctnnd1P30999 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctnnd1P30999 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctnnd1P30999 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ctnnd1P30999 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ctnnd1P30999 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctnnd1P30999 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ctnnd1P30999 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ctnnd1P30999 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ctnnd1P30999 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ctnnd1P30999 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnnd1P30999 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnnd1P30999 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnnd1P30999 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ctnnd1P30999 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctnnd1P30999 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ctnnd1P30999 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ctnnd1P30999 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctnnd1P30999 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctnnd1P30999 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ctnnd1P30999 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ctnnd1P30999 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ctnnd1P30999 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms