Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HexaP29416 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HexaP29416 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HexaP29416 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HexaP29416 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HexaP29416 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HexaP29416 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HexaP29416 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HexaP29416 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HexaP29416 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HexaP29416 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HexaP29416 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HexaP29416 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HexaP29416 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HexaP29416 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HexaP29416 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HexaP29416 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HexaP29416 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HexaP29416 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HexaP29416 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HexaP29416 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HexaP29416 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HexaP29416 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HexaP29416 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HexaP29416 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HexaP29416 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HexaP29416 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HexaP29416 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HexaP29416 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HexaP29416 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HexaP29416 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HexaP29416 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HexaP29416 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HexaP29416 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HexaP29416 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HexaP29416 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HexaP29416 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HexaP29416 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HexaP29416 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HexaP29416 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HexaP29416 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HexaP29416 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HexaP29416 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HexaP29416 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HexaP29416 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HexaP29416 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HexaP29416 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HexaP29416 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HexaP29416 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HexaP29416 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HexaP29416 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HexaP29416 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HexaP29416 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HexaP29416 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HexaP29416 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HexaP29416 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HexaP29416 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HexaP29416 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HexaP29416 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HexaP29416 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HexaP29416 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HexaP29416 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HexaP29416 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HexaP29416 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HexaP29416 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HexaP29416 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HexaP29416 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HexaP29416 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HexaP29416 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HexaP29416 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HexaP29416 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HexaP29416 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HexaP29416 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HexaP29416 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HexaP29416 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HexaP29416 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HexaP29416 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HexaP29416 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HexaP29416 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HexaP29416 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HexaP29416 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HexaP29416 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HexaP29416 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HexaP29416 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HexaP29416 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HexaP29416 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HexaP29416 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HexaP29416 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HexaP29416 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HexaP29416 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HexaP29416 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HexaP29416 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HexaP29416 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HexaP29416 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HexaP29416 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HexaP29416 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HexaP29416 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HexaP29416 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HexaP29416 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HexaP29416 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms