Protein–RNA interactions for Protein: P29416

Hexa, Beta-hexosaminidase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HexaP29416 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HexaP29416 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HexaP29416 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HexaP29416 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HexaP29416 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HexaP29416 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
HexaP29416 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HexaP29416 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HexaP29416 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HexaP29416 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HexaP29416 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HexaP29416 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HexaP29416 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HexaP29416 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HexaP29416 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HexaP29416 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
HexaP29416 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HexaP29416 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HexaP29416 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HexaP29416 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HexaP29416 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HexaP29416 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HexaP29416 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HexaP29416 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HexaP29416 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HexaP29416 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HexaP29416 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HexaP29416 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HexaP29416 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HexaP29416 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HexaP29416 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HexaP29416 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HexaP29416 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HexaP29416 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HexaP29416 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HexaP29416 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HexaP29416 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HexaP29416 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HexaP29416 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HexaP29416 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HexaP29416 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HexaP29416 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HexaP29416 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HexaP29416 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HexaP29416 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HexaP29416 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HexaP29416 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HexaP29416 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HexaP29416 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HexaP29416 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HexaP29416 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HexaP29416 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HexaP29416 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HexaP29416 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HexaP29416 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HexaP29416 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HexaP29416 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HexaP29416 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HexaP29416 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HexaP29416 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
HexaP29416 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HexaP29416 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HexaP29416 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HexaP29416 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HexaP29416 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HexaP29416 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HexaP29416 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HexaP29416 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HexaP29416 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HexaP29416 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HexaP29416 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HexaP29416 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HexaP29416 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HexaP29416 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HexaP29416 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HexaP29416 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HexaP29416 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HexaP29416 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HexaP29416 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HexaP29416 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HexaP29416 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
HexaP29416 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HexaP29416 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HexaP29416 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HexaP29416 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HexaP29416 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HexaP29416 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HexaP29416 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HexaP29416 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HexaP29416 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HexaP29416 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HexaP29416 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HexaP29416 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
HexaP29416 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HexaP29416 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HexaP29416 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
HexaP29416 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HexaP29416 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HexaP29416 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
HexaP29416 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms