Protein–RNA interactions for Protein: P28309

Defa2, Alpha-defensin 2, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa2P28309 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Defa2P28309 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa2P28309 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Defa2P28309 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Defa2P28309 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Defa2P28309 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa2P28309 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa2P28309 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa2P28309 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Defa2P28309 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Defa2P28309 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa2P28309 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa2P28309 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Defa2P28309 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa2P28309 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa2P28309 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Defa2P28309 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Defa2P28309 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa2P28309 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa2P28309 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa2P28309 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa2P28309 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Defa2P28309 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa2P28309 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Defa2P28309 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Defa2P28309 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa2P28309 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Defa2P28309 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Defa2P28309 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Defa2P28309 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Defa2P28309 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Defa2P28309 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa2P28309 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa2P28309 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa2P28309 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa2P28309 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Defa2P28309 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa2P28309 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa2P28309 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa2P28309 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa2P28309 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Defa2P28309 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms